Mus musculus Protein: Cdk13 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-131937.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Cdk13 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | cyclin-dependent kinase 13 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2310015O17Rik; Cdc2l5; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000036013 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-131935 (Cdk13) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Cyclin-dependent kinase which displays CTD kinase activity and is required for RNA splicing. Has CTD kinase activity by hyperphosphorylating the C-terminal heptapeptide repeat domain (CTD) of the largest RNA polymerase II subunit RPB1, thereby acting as a key regulator of transcription elongation. Required for RNA splicing, probably by phosphorylating SRSF1/SF2. Required during hematopoiesis. {ECO:0000269PubMed:17261272}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus speckle {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 16 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1916812 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000719
Protein kinase domain IPR001245 Serine-threonine/tyrosine-protein kinase catalytic domain IPR002290 Serine/threonine- /dual specificity protein kinase, catalytic domain IPR011009 Protein kinase-like domain IPR020635 Tyrosine-protein kinase, catalytic domain |
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PFAM |
PF00069
PF07714 |
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PRINTS |
PR00109
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00220
SM00219 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q69ZA1 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q69ZA1 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q3UF50 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 69562 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.415880 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_081394 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Cdk13 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS36604 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC154219 AC154828 AK035493 AK148986 AK173265 BC032179 BC051093 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH32179 AAH51093 BAC29077 BAD32543 BAE28711 | ||||||||||||||||||||||