Mus musculus Protein: Vim | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-137866.6 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Vim | ||||||||||||||||||||||||
Protein Name | vimentin | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000028062 | ||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-137864 (Vim) | ||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||
Function | Vimentins are class-III intermediate filaments found in various non-epithelial cells, especially mesenchymal cells. Vimentin is attached to the nucleus, endoplasmic reticulum, and mitochondria, either laterally or terminally.Involved with LARP6 in the stabilization of type I collagen mRNAs for CO1A1 and CO1A2. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 52 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 189 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:98932 | ||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001664
Intermediate filament protein IPR006821 Intermediate filament head, DNA-binding domain IPR009053 Prefoldin |
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PFAM |
PF00038
PF04732 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||
SMART | |||||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P20152 | ||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P20152 | ||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q5FWJ3 | ||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 22352 | ||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.402398 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_035831 | ||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Vim | ||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS15696 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | AK033175 AK133726 AK170429 AL772303 BC089335 CH466542 D50805 M24849 M26251 X51438 X56397 Y07738 Z22526 | ||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA40555 AAA40556 AAH89335 BAA19834 BAC28181 BAE21803 BAE41790 CAA35803 CAA39807 CAA69019 CAA80251 EDL08054 | ||||||||||||||||||||||||