Homo sapiens Protein: TNFRSF1A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-13809.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TNFRSF1A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | tumor necrosis factor receptor superfamily, member 1A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CD120a; FPF; MS5; p55; p55-R; p60; TBP1; TNF-R; TNF-R-I; TNF-R55; TNFAR; TNFR1; TNFR1-d2; TNFR55; TNFR60; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000162749 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-13807 (TNFRSF1A) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Receptor for TNFSF2/TNF-alpha and homotrimeric TNFSF1/lymphotoxin-alpha. The adapter molecule FADD recruits caspase-8 to the activated receptor. The resulting death-inducing signaling complex (DISC) performs caspase-8 proteolytic activation which initiates the subsequent cascade of caspases (aspartate- specific cysteine proteases) mediating apoptosis. Contributes to the induction of non-cytocidal TNF effects including anti-viral state and activation of the acid sphingomyelinase. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cell membrane {ECO:0000269PubMed:22801493}; Single-pass type I membrane protein {ECO:0000269PubMed:22801493}. Golgi apparatus membrane {ECO:0000269PubMed:22801493}; Single- pass type I membrane protein {ECO:0000269PubMed:22801493}. Secreted {ECO:0000269PubMed:22801493}. Note=A secreted form is produced through proteolytic processing.Isoform 4: Secreted. Note=Lacks a Golgi- retention motif, is not membrane bound and therefore is secreted. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | Familial hibernian fever (FHF) [MIM:142680]: A hereditary periodic fever syndrome characterized by recurrent fever, abdominal pain, localized tender skin lesions and myalgia. Reactive amyloidosis is the main complication and occurs in 25% of cases. {ECO:0000269PubMed:10199409, ECO:0000269PubMed:10902757, ECO:0000269PubMed:11443543, ECO:0000269PubMed:13130484, ECO:0000269PubMed:14610673}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry.Multiple sclerosis 5 (MS5) [MIM:614810]: A multifactorial, inflammatory, demyelinating disease of the central nervous system. Sclerotic lesions are characterized by perivascular infiltration of monocytes and lymphocytes and appear as indurated areas in pathologic specimens (sclerosis in plaques). The pathological mechanism is regarded as an autoimmune attack of the myelin sheath, mediated by both cellular and humoral immunity. Clinical manifestations include visual loss, extra-ocular movement disorders, paresthesias, loss of sensation, weakness, dysarthria, spasticity, ataxia and bladder dysfunction. Genetic and environmental factors influence susceptibility to the disease. {ECO:0000269PubMed:22801493}. Note=Disease susceptibility is associated with variations affecting the gene represented in this entry. An intronic mutation affecting alternative splicing and skipping of exon 6 directs increased expression of isoform 4 a transcript encoding a C-terminally truncated protein which is secreted and may function as a TNF antagonist. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 168 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 30 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000488
Death domain IPR001368 TNFR/NGFR cysteine-rich region IPR011029 Death-like domain IPR020419 Tumour necrosis factor receptor 1A |
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PFAM |
PF00531
PF00020 |
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PRINTS |
PR01918
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00005
SM00208 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P19438 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P19438 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | J9PH39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 7132 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.279594 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001056 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:11916 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 191190 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS8542 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 01861 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC006057 AK056611 AK291088 AK298729 AK304517 AK315509 AY131997 BC010140 CH471116 EU927389 JN172914 M33294 M58286 M60275 M63121 M75864 M75865 M75866 X55313 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA03210 AAA36753 AAA36754 AAA36756 AAA61201 AAH10140 AAM77802 ACH57451 AEO89726 BAF83777 BAG37891 BAG51763 BAG60879 BAG65321 CAA39021 EAW88805 EAW88806 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||