Homo sapiens Protein: ZFR | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-14602.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | ZFR | ||||||||||||||||||
Protein Name | zinc finger RNA binding protein | ||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000265069 | ||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-14600 (ZFR) | ||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
Function | Involved in postimplantation and gastrulation stages of development. Involved in the nucleocytoplasmic shuttling of STAU2. Binds to DNA and RNA (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000250}. Cytoplasm {ECO:0000250}. Cytoplasmic granule {ECO:0000250}. Chromosome {ECO:0000250}. Note=Associated with chromosome foci in meiotic cells. Localizes in somatodendritic compartment of primary hippocampal neurons. Colocalizes with STAU2 in several cytosolic RNA granules (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed in lung, liver, lymphocytes, heart, pancreas, placenta, brain and kidney. {ECO:0000269PubMed:11574164}. | ||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 42 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||
InterPro |
IPR003604
Zinc finger, U1-type IPR006561 DZF domain IPR015880 Zinc finger, C2H2-like IPR022755 Zinc finger, double-stranded RNA binding |
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PFAM |
PF07528
PF12171 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||
SMART |
SM00451
SM00572 SM00355 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | Q96KR1 | ||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q96KR1 | ||||||||||||||||||
TrEMBL | B3KP82 | ||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 51663 | ||||||||||||||||||
UniGene | Hs.435231 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NP_057191 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:17277 | ||||||||||||||||||
OMIM | 615635 | ||||||||||||||||||
CCDS | CCDS34139 | ||||||||||||||||||
HPRD | 15730 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AC008949 AF100742 AJ314790 AK025481 AK055938 AK295297 AL137258 BC030540 BC051893 BC062986 BC107417 BC137084 | ||||||||||||||||||
GenPept | AAD40385 AAH30540 AAH51893 AAH62986 AAI07418 AAI37085 BAB15147 BAG51594 BAG58279 CAB70659 CAC40818 | ||||||||||||||||||