Mus musculus Protein: Amfr | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-181241.6 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Amfr | ||||||||||||||||||||||||
Protein Name | autocrine motility factor receptor | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | gp78; | ||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000052258 | ||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-181239 (Amfr) | ||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||
Function | E3 ubiquitin-protein ligase that mediates the polyubiquitination of a number of proteins such as CD3D, CYP3A4, CFTR and APOB for proteasomal degradation. Component of a VCP/p97- AMFR/gp78 complex that participates in the final step of endoplasmic reticulum-associated degradation (ERAD). The VCP/p97- AMFR/gp78 complex is involved in the sterol-accelerated ERAD degradation of HMGCR through binding to the HMGCR-INSIG complex at the ER membrane and initiating ubiquitination of HMGCR. The ubiquitinated HMGCR is then released from the ER by the complex into the cytosol for subsequent destruction. Also acts as a scaffold protein to assemble a complex that couples ubiquitination, retranslocation and deglycosylation. Mediates tumor invasion and metastasis (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Endoplasmic reticulum membrane {ECO:0000250}; Multi-pass membrane protein {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed in heart, brain, liver, lung, skeletal muscle, kidney and testis. Not detected in spleen. {ECO:0000269PubMed:10456327}. | ||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 13 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 77 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1345634 | ||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001841
Zinc finger, RING-type IPR003892 Ubiquitin system component Cue IPR018957 Zinc finger, C3HC4 RING-type |
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PFAM |
PF13639
PF14634 PF02845 PF00097 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00184
SM00546 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9R049 | ||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9R049 | ||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q3U007 | ||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 23802 | ||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.399630 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_035917 | ||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Amfr | ||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS22533 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF124144 AK157327 AK170716 BC003256 BC034538 BC040338 | ||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAD56721 AAH03256 AAH34538 AAH40338 BAE34049 BAE41974 | ||||||||||||||||||||||||