Mus musculus Protein: Gabarapl2 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-193759.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Gabarapl2 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor-associated protein-like 2 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 0610012F20Rik; 2900019O08Rik; AI173605; GATE-16; Gef2; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000034428 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-193757 (Gabarapl2) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Ubiquitin-like modifier involved in intra-Golgi traffic. Modulates intra-Golgi transport through coupling between NSF activity and SNAREs activation. It first stimulates the ATPase activity of NSF which in turn stimulates the association with GOSR1 (By similarity). Involved in autophagy. Plays a role in mitophagy which contributes to regulate mitochondrial quantity and quality by eliminating the mitochondria to a basal level to fulfill cellular energy requirements and preventing excess ROS production. Whereas LC3s are involved in elongation of the phagophore membrane, the GABARAP/GATE-16 subfamily is essential for a later stage in autophagosome maturation. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Golgi apparatus {ECO:0000250}. Cytoplasmic vesicle, autophagosome {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Ubiquitous. A high level expression is seen in brain, thymus, lung, heart, liver and kidney. {ECO:0000269PubMed:11414770}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 111 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1890602 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR004241
Autophagy protein Atg8 ubiquitin like IPR007242 Ubiquitin-like protein Atg12 IPR029071 Ubiquitin-related domain |
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PFAM |
PF02991
PF04110 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART | |||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | P60521 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P60521 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 93739 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.449916 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_080969 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Gabarapl2 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS40480 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AF190644 AK002596 AK049819 BC026798 BC081436 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH26798 AAH81436 AAK16238 BAB22217 BAC33933 | ||||||||||||||||||||||