Homo sapiens Protein: TRIM71 | |||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-23896.6 | ||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TRIM71 | ||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | tripartite motif containing 71 | ||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000373272 | ||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-23894 (TRIM71) | ||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||
Function | E3 ubiquitin-protein ligase that cooperates with the microRNAs (miRNAs) machinery and promotes embryonic stem cells proliferation and maintenance. Binds to miRNAs and associates with AGO2, participating in post-transcriptional repression of transcripts such as CDKN1A. Facilitates the G1-S transition to promote rapid embryonic stem cell self-renewal by repressing CDKN1A expression. Required to maintain proliferation and prevent premature differentiation of neural progenitor cells during early neural development: positively regulates FGF signaling by controlling the stability of SHCBP1 (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm, P-body {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Specifically expressed in testis. {ECO:0000269PubMed:15722555}. | ||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 5 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 7 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000315
Zinc finger, B-box IPR001258 NHL repeat IPR001298 Filamin/ABP280 repeat IPR001841 Zinc finger, RING-type IPR013017 NHL repeat, subgroup IPR014756 Immunoglobulin E-set IPR017868 Filamin/ABP280 repeat-like |
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PFAM |
PF00643
PF01436 PF13639 PF14634 PF00630 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00336
SM00557 SM00184 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q2Q1W2 | ||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q2Q1W2 | ||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 131405 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.598720 | ||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001034200 | ||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:32669 | ||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS43060 | ||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | DQ232881 | ||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | ABB18374 | ||||||||||||||||||||||||||||