Homo sapiens Protein: TRIM23 | |||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-24053.7 | ||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TRIM23 | ||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | tripartite motif containing 23 | ||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | ARD1; ARFD1; RNF46; | ||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000370406 | ||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-24045 (TRIM23) | ||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||
Function | Acts as an E3 ubiquitin-protein ligase. In the presence of the human cytomegalovirus (HCMV) protein UL144, participates in 'Lys-63'-linked auto-ubiquitination of TRAF6 resulting in the virally controlled activation of NF-kappa-B at early time of infection. The C-terminus can act as an allosteric activator of the cholera toxin catalytic subunit. {ECO:0000269PubMed:15684077}. | ||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Endomembrane system {ECO:0000269PubMed:9671726}. Golgi apparatus membrane {ECO:0000269PubMed:9671726}. Lysosome membrane {ECO:0000269PubMed:9671726}. Note=Membrane-associated with the Golgi complex and lysosomal structures. | ||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 157 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000315
Zinc finger, B-box IPR001019 Guanine nucleotide binding protein (G-protein), alpha subunit IPR001806 Small GTPase superfamily IPR001841 Zinc finger, RING-type IPR003579 Small GTPase superfamily, Rab type IPR003649 B-box, C-terminal IPR005225 Small GTP-binding protein domain IPR006687 Small GTPase superfamily, SAR1-type IPR006689 Small GTPase superfamily, ARF/SAR type IPR006762 Gtr1/RagA G protein IPR007087 Zinc finger, C2H2 IPR013684 Mitochondrial Rho-like IPR019009 Signal recognition particle receptor, beta subunit IPR024156 Small GTPase superfamily, ARF type IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
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PFAM |
PF00643
PF00503 PF00071 PF13639 PF14634 PF00025 PF04670 PF00096 PF08477 PF09439 |
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PRINTS |
PR00318
PR00449 PR00328 |
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00336
SM00275 SM00184 SM00175 SM00502 SM00178 SM00177 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P36406 | ||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P36406 | ||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | D6R9E9 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 373 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.792 | ||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_150230 | ||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:660 | ||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 601747 | ||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS43322 | ||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 03449 | ||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC008560 AF230397 AF230398 AF230399 BC022510 L04510 | ||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA35940 AAG50176 AAG50177 AAG50178 AAH22510 | ||||||||||||||||||||||||||||