Homo sapiens Protein: STAT1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-245892.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | STAT1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | signal transducer and activator of transcription 1, 91kDa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CANDF7; IMD31A; IMD31B; IMD31C; ISGF-3; STAT91; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000376136 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-77617 (STAT1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Signal transducer and transcription activator that mediates cellular responses to interferons (IFNs), cytokine KITLG/SCF and other cytokines and other growth factors. Following type I IFN (IFN-alpha and IFN-beta) binding to cell surface receptors, signaling via protein kinases leads to activation of Jak kinases (TYK2 and JAK1) and to tyrosine phosphorylation of STAT1 and STAT2. The phosphorylated STATs dimerize and associate with ISGF3G/IRF-9 to form a complex termed ISGF3 transcription factor, that enters the nucleus. ISGF3 binds to the IFN stimulated response element (ISRE) to activate the transcription of IFN- stimulated genes (ISG), which drive the cell in an antiviral state. In response to type II IFN (IFN-gamma), STAT1 is tyrosine- and serine-phosphorylated. It then forms a homodimer termed IFN- gamma-activated factor (GAF), migrates into the nucleus and binds to the IFN gamma activated sequence (GAS) to drive the expression of the target genes, inducing a cellular antiviral state. Becomes activated in response to KITLG/SCF and KIT signaling. May mediate cellular responses to activated FGFR1, FGFR2, FGFR3 and FGFR4. {ECO:0000269PubMed:12764129, ECO:0000269PubMed:12855578, ECO:0000269PubMed:15322115, ECO:0000269PubMed:19088846, ECO:0000269PubMed:9724754}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm {ECO:0000269PubMed:15322115}. Nucleus {ECO:0000269PubMed:15322115}. Note=Translocated into the nucleus upon tyrosine phosphorylation and dimerization, in response to IFN-gamma and signaling by activated FGFR1, FGFR2, FGFR3 or FGFR4. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | STAT1 deficiency complete (STAT1D) [MIM:613796]: A disorder characterized by susceptibility to severe mycobacterial and viral infections. Affected individuals can develop disseminated infections and die of viral illness. {ECO:0000269PubMed:12590259, ECO:0000269PubMed:20841510}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry.Mendelian susceptibility to mycobacterial disease (MSMD) [MIM:209950]: This rare condition confers predisposition to illness caused by moderately virulent mycobacterial species, such as Bacillus Calmette-Guerin (BCG) vaccine and environmental non- tuberculous mycobacteria, and by the more virulent Mycobacterium tuberculosis. Other microorganisms rarely cause severe clinical disease in individuals with susceptibility to mycobacterial infections, with the exception of Salmonella which infects less than 50% of these individuals. The pathogenic mechanism underlying MSMD is the impairment of interferon-gamma mediated immunity, whose severity determines the clinical outcome. Some patients die of overwhelming mycobacterial disease with lepromatous-like lesions in early childhood, whereas others develop, later in life, disseminated but curable infections with tuberculoid granulomas. MSMD is a genetically heterogeneous disease with autosomal recessive, autosomal dominant or X-linked inheritance. {ECO:0000269PubMed:11452125, ECO:0000269PubMed:16934001, ECO:0000269PubMed:22573496}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry.Candidiasis, familial, 7 (CANDF7) [MIM:614162]: A primary immunodeficiency disorder with altered immune responses and impaired clearance of fungal infections, selective against Candida. It is characterized by persistent and/or recurrent infections of the skin, nails and mucous membranes caused by organisms of the genus Candida, mainly Candida albicans. {ECO:0000269PubMed:21714643, ECO:0000269PubMed:21727188}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry. STAT1 mutations in patients with autosomal dominant candidiasis lead to defective responses of type 1 and type 17 helper T-cells, characterized by reduced production of interferon-alpha, interleukin-17, and interleukin-22. These cytokines are crucial for the antifungal defense of skin and mucosa (PubMed:21714643). {ECO:0000269PubMed:21714643}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 332 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 31 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000980
SH2 domain IPR008967 p53-like transcription factor, DNA-binding IPR013799 STAT transcription factor, protein interaction IPR013800 STAT transcription factor, all-alpha IPR013801 STAT transcription factor, DNA-binding IPR015988 STAT transcription factor, coiled coil |
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PFAM |
PF00017
PF14633 PF02865 PF01017 PF02864 |
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PRINTS |
PR00401
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00252
SM00964 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P42224 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P42224 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q67C41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 6772 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.743244 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_644671 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:11362 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 600555 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS42793 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 02777 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC067945 AK292604 AK315002 AY366464 AY865620 BC002704 BT007241 CH471058 CR749636 GU211347 M97935 M97936 U18662 U18663 U18664 U18665 U18666 U18667 U18668 U18669 U18670 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB64012 AAH02704 AAP35905 AAR13284 AAW56072 AAY24183 ADA59516 BAF85293 BAG37497 CAH18430 EAX10850 EAX10851 EAX10852 EAX10855 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||