Homo sapiens Protein: WDR48 | |||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-26455.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | WDR48 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | WD repeat domain 48 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000307491 | ||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-26453 (WDR48) | ||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Regulator of deubiquitinating complexes. Acts as a strong activator of USP1 by enhancing the USP1-mediated deubiquitination of FANCD2; USP1 being almost inactive by itself. Also activates deubiquitinating activity of complexes containing USP12 and USP46, respectively. Activates deubiquitination by increasing the catalytic turnover without increasing the affinity of deubiquitinating enzymes for the substrate. In case of infection by Herpesvirus saimiri, may play a role in vesicular transport or membrane fusion events necessary for transport to lysosomes. Induces lysosomal vesicle formation via interaction with Herpesvirus saimiri tyrosine kinase-interacting protein (TIP). Subsequently, TIP recruits tyrosine-protein kinase LCK, resulting in down-regulation of T-cell antigen receptor TCR. May play a role in generation of enlarged endosomal vesicles via interaction with TIP. In case of infection by papillomavirus HPV11, promotes the maintenance of the viral genome via its interaction with HPV11 helicase E1. {ECO:0000269PubMed:12196293, ECO:0000269PubMed:18082604, ECO:0000269PubMed:19075014}. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus. Cytoplasm. Lysosome. Note=Mainly cytoplasmic. In case of infection by papillomavirus HPV11, translocates to the nucleus via its interaction with papillomavirus HPV11. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Ubiquitous. {ECO:0000269PubMed:12196293}. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 79 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001680
WD40 repeat IPR017986 WD40-repeat-containing domain IPR020472 G-protein beta WD-40 repeat IPR021772 Protein of unknown function DUF3337 |
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PFAM |
PF00400
PF11816 |
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PRINTS |
PR00320
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00320
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q8TAF3 | ||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q8TAF3 | ||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F8W7Y5 | ||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 57599 | ||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.733733 | ||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_065890 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:30914 | ||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 612167 | ||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS33738 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 11146 | ||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB040882 AC123903 AC138124 AF468833 AK297349 AK298810 AK302307 AL162064 AL832926 BC026353 BC037168 BX649170 CH471055 | ||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH26353 AAH37168 AAL78650 BAA95973 BAG59798 BAG60944 BAG63646 CAB82402 CAH56182 CAH56300 EAW64550 EAW64551 | ||||||||||||||||||||||||||||||