Homo sapiens Protein: SETD1A | |||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-27373.5 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | SETD1A | ||||||||||||||||||
Protein Name | SET domain containing 1A | ||||||||||||||||||
Synonyms | KMT2F; Set1; Set1A; | ||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000262519 | ||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-27371 (SETD1A) | ||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
Function | Histone methyltransferase that specifically methylates 'Lys-4' of histone H3, when part of the SET1 histone methyltransferase (HMT) complex, but not if the neighboring 'Lys- 9' residue is already methylated. H3 'Lys-4' methylation represents a specific tag for epigenetic transcriptional activation. The non-overalpping localization with SETD1B suggests that SETD1A and SETD1B make non-redundant contributions to the epigenetic control of chromatin structure and gene expression. {ECO:0000269PubMed:12670868}. | ||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus speckle {ECO:0000269PubMed:17355966}. Chromosome {ECO:0000269PubMed:17355966}. Note=Localizes to a largely non- overlapping set of euchromatic nuclear speckles with SETD1B, suggesting that SETD1A and SETD1B each bind to a unique set of target genes. | ||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 42 experimentally validated interaction(s) in this database.
|
||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||
Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000504
RNA recognition motif domain IPR001214 SET domain IPR003616 Post-SET domain IPR024657 COMPASS complex Set1 subunit, N-SET domain |
||||||||||||||||||
PFAM |
PF00076
PF00856 PF11764 |
||||||||||||||||||
PRINTS | |||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||
SMART |
SM00360
SM00317 SM00508 |
||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | O15047 | ||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-O15047 | ||||||||||||||||||
TrEMBL | C9J2Z9 | ||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 9739 | ||||||||||||||||||
UniGene | Hs.614412 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NP_055527 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:29010 | ||||||||||||||||||
OMIM | 611052 | ||||||||||||||||||
CCDS | CCDS32435 | ||||||||||||||||||
HPRD | 13795 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AB002337 AC135048 BC027450 BC035795 | ||||||||||||||||||
GenPept | AAH27450 AAH35795 BAA20797 | ||||||||||||||||||