Version 5.4
| Homo sapiens Protein: SETDB2 | |||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Protein | IDBP-33319.6 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | SETDB2 | ||||||||||||||||||
| Protein Name | SET domain, bifurcated 2 | ||||||||||||||||||
| Synonyms | |||||||||||||||||||
| Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
| Ensembl Protein | ENSP00000258672 | ||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-33315 (SETDB2) | ||||||||||||||||||
| Protein Structure |
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| UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
| Function | Histone methyltransferase involved in left-right axis specification in early development and mitosis. Specifically trimethylates 'Lys-9' of histone H3 (H3K9me3). H3K9me3 is a specific tag for epigenetic transcriptional repression that recruits HP1 (CBX1, CBX3 and/or CBX5) proteins to methylated histones. Contributes to H3K9me3 in both the interspersed repetitive elements and centromere-associated repeats. Plays a role in chromosome condensation and segregation during mitosis. {ECO:0000269PubMed:20404330}. | ||||||||||||||||||
| Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000269PubMed:20404330}. Chromosome {ECO:0000305PubMed:20404330}. | ||||||||||||||||||
| Disease Associations | |||||||||||||||||||
| Tissue Specificity | Ubiquitous. Highest expression in heart, testis and ovary. | ||||||||||||||||||
| Comments | |||||||||||||||||||
| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
| PDB ID | |||||||||||||||||||
| InterPro |
IPR001214
SET domain IPR001739 Methyl-CpG DNA binding IPR003606 Pre-SET zinc-binding sub-group IPR007728 Pre-SET domain IPR016177 DNA-binding domain |
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| PFAM |
PF00856
PF01429 PF05033 |
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| PRINTS | |||||||||||||||||||
| PIRSF | |||||||||||||||||||
| SMART |
SM00317
SM00391 SM00468 |
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| TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
| Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
| Modification | |||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | |||||||||||||||||||
| PhosphoSite | PhosphoSite-Q96T68 | ||||||||||||||||||
| TrEMBL | X6R383 | ||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 83852 | ||||||||||||||||||
| UniGene | |||||||||||||||||||
| RefSeq | XP_005266627 | ||||||||||||||||||
| HUGO | HGNC:20263 | ||||||||||||||||||
| OMIM | 607865 | ||||||||||||||||||
| CCDS | |||||||||||||||||||
| HPRD | 09712 | ||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| EMBL | AL136218 AL139321 | ||||||||||||||||||
| GenPept | |||||||||||||||||||