Version 5.4
| Homo sapiens Protein: CPSF3L | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Protein | IDBP-361384.5 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | CPSF3L | ||||||||||||||||||
| Protein Name | cleavage and polyadenylation specific factor 3-like | ||||||||||||||||||
| Synonyms | |||||||||||||||||||
| Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
| Ensembl Protein | ENSP00000404886 | ||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-85005 (CPSF3L) | ||||||||||||||||||
| Protein Structure |
|
||||||||||||||||||
| UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
| Function | Catalytic component of the Integrator complex, a complex involved in the small nuclear RNAs (snRNA) U1 and U2 transcription and in their 3'-box-dependent processing. The Integrator complex is associated with the C-terminal domain (CTD) of RNA polymerase II largest subunit (POLR2A) and is recruited to the U1 and U2 snRNAs genes. Mediates the snRNAs 3' cleavage. {ECO:0000269PubMed:16239144}. | ||||||||||||||||||
| Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000269PubMed:15684398}. Cytoplasm {ECO:0000269PubMed:15684398}. | ||||||||||||||||||
| Disease Associations | |||||||||||||||||||
| Tissue Specificity | |||||||||||||||||||
| Comments | |||||||||||||||||||
| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 23 experimentally validated interaction(s) in this database.
|
||||||||||||||||||
| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||
| Biological Process |
|
||||||||||||||||||
| Cellular Component |
|
||||||||||||||||||
| Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
| PDB ID | |||||||||||||||||||
| InterPro |
IPR001279
Beta-lactamase-like IPR011108 RNA-metabolising metallo-beta-lactamase IPR022712 Beta-Casp domain |
||||||||||||||||||
| PFAM |
PF00753
PF07521 PF10996 |
||||||||||||||||||
| PRINTS | |||||||||||||||||||
| PIRSF | |||||||||||||||||||
| SMART |
SM00849
SM01027 |
||||||||||||||||||
| TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
| Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
| Modification | |||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | Q5TA45 | ||||||||||||||||||
| PhosphoSite | PhosphoSite-Q5TA45 | ||||||||||||||||||
| TrEMBL | J3QRY6 | ||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 54973 | ||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.739302 | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_001243392 | ||||||||||||||||||
| HUGO | HGNC:26052 | ||||||||||||||||||
| OMIM | 611354 | ||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS57961 | ||||||||||||||||||
| HPRD | 13377 | ||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| EMBL | AK000549 AK021939 AK023356 AK056652 AK291387 AK297350 AL136813 AL139287 BC000675 BC007978 BC013904 BK005673 BK005728 CH471183 CR533557 | ||||||||||||||||||
| GenPept | AAH00675 AAH07978 AAH13904 BAA91246 BAB13943 BAB14541 BAF84076 BAG51775 BAG59799 CAB66747 CAG38588 CAI23174 CAI23176 CAI23177 CAI23179 CAI23180 CAI23181 DAA05669 DAA05728 EAW56235 EAW56238 EAW56239 EAW56240 EAW56242 | ||||||||||||||||||