Homo sapiens Protein: TOP2B | |||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-368142.5 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TOP2B | ||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | topoisomerase (DNA) II beta 180kDa | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | top2beta; TOPIIB; | ||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000396704 | ||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-22611 (TOP2B) | ||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||
Function | Control of topological states of DNA by transient breakage and subsequent rejoining of DNA strands. Topoisomerase II makes double-strand breaks. Indirectly involved in vitamin D- coupled transcription regulation via its association with the WINAC complex, a chromatin-remodeling complex recruited by vitamin D receptor (VDR), which is required for the ligand-bound VDR- mediated transrepression of the CYP27B1 gene. {ECO:0000269PubMed:10684600, ECO:0000269PubMed:12837248}. | ||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm. Nucleus, nucleolus. | ||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 62 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001154
DNA topoisomerase II, eukaryotic-type IPR001241 DNA topoisomerase, type IIA IPR002205 DNA topoisomerase, type IIA, subunit A/C-terminal IPR003594 Histidine kinase-like ATPase, C-terminal domain IPR012542 DTHCT IPR013506 DNA topoisomerase, type IIA, subunit B, domain 2 IPR013760 DNA topoisomerase, type IIA-like domain IPR020568 Ribosomal protein S5 domain 2-type fold |
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PFAM |
PF00521
PF02518 PF13581 PF08070 PF00204 |
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PRINTS |
PR01158
PR00418 |
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00433
SM00434 SM00387 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q02880 | ||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q02880 | ||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q8WTY5 | ||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 7155 | ||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.614320 | ||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001059 | ||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:11990 | ||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 126431 | ||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS46776 | ||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 00537 | ||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC093416 AJ011721 AJ011722 AJ011723 AJ011724 AJ011725 AJ011726 AJ011727 AJ011728 AJ011729 AJ011730 AJ011731 AJ011732 AK297171 BC021863 M27504 U54831 U65315 U96765 X53662 X68060 X71911 Z15111 Z15115 | ||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA61210 AAB01982 AAB54121 AAB95437 AAH21863 BAG59664 CAA09753 CAA37706 CAA48197 CAA78815 CAA78821 | ||||||||||||||||||||||||||