Homo sapiens Protein: PTPRO | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-368338.5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PTPRO | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | protein tyrosine phosphatase, receptor type, O | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | GLEPP1; NPHS6; PTP-OC; PTP-U2; PTPROT; PTPU2; R-PTP-O; | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000393449 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-21457 (PTPRO) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Possesses tyrosine phosphatase activity. Plays a role in regulating the glomerular pressure/filtration rate relationship through an effect on podocyte structure and function (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Membrane; Single-pass type I membrane protein. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | Nephrotic syndrome 6 (NPHS6) [MIM:614196]: A form of nephrotic syndrome, a renal disease clinically characterized by severe proteinuria, resulting in complications such as hypoalbuminemia, hyperlipidemia and edema. Kidney biopsies show non-specific histologic changes such as focal segmental glomerulosclerosis and diffuse mesangial proliferation. Some affected individuals have an inherited steroid-resistant form and progress to end-stage renal failure. {ECO:0000269PubMed:21722858}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Glomerulus of kidney. Also detected in brain, lung and placenta. {ECO:0000269PubMed:10498613}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 37 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000242
Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type IPR000387 Protein-tyrosine/Dual specificity phosphatase IPR003595 Protein-tyrosine phosphatase, catalytic IPR029021 Protein-tyrosine phosphatase-like |
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PFAM |
PF00102
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PRINTS |
PR00700
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00194
SM00404 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q16827 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q16827 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | B4DS16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 5800 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.160871 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_109596 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:9678 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 600579 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS44837 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 02784 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC007542 AC022334 AC092183 AF187043 AF187044 AK290982 AK299529 BC035960 BC126201 BC126203 CH471094 U20489 Z48541 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA82892 AAF04086 AAF04087 AAH35960 AAI26202 AAI26204 BAF83671 BAG61478 CAA88425 EAW96349 EAW96350 EAW96351 EAW96352 | ||||||||||||||||||||||||||||||||