Homo sapiens Protein: LTB | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-371563.4 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | LTB | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | lymphotoxin beta (TNF superfamily, member 3) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | p33; TNFC; TNFSF3; | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000410481 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-302504 (LTB) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Cytokine that binds to LTBR/TNFRSF3. May play a specific role in immune response regulation. Provides the membrane anchor for the attachment of the heterotrimeric complex to the cell surface. Isoform 2 is probably non-functional. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Membrane {ECO:0000305}; Single-pass type II membrane protein {ECO:0000305}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Spleen and thymus. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR002961
Lymphotoxin-beta IPR006052 Tumour necrosis factor domain IPR006053 Tumour necrosis factor IPR008983 Tumour necrosis factor-like domain |
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PFAM |
PF00229
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PRINTS |
PR01237
PR01234 |
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00207
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q06643 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite- | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q5STB2 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 4050 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_002332 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:6711 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 600978 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS4703 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 02987 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AB088106 AB103612 AB202114 AF129756 AK312210 AY070219 AY216497 BA000025 BC069330 BC093783 CH471081 L11015 L11016 U79029 U89922 Y14768 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA36191 AAA99888 AAB37342 AAC51769 AAD18089 AAH69330 AAH93783 AAL49954 AAL49955 AAO21134 BAB63395 BAC54938 BAE78640 BAF31273 BAG35143 CAA75069 EAX03425 EAX03426 | ||||||||||||||||||||||