Homo sapiens Protein: RARA | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-377720.5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RARA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | retinoic acid receptor, alpha | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | NR1B1; RAR; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000389993 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-47411 (RARA) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Receptor for retinoic acid. Retinoic acid receptors bind as heterodimers to their target response elements in response to their ligands, all-trans or 9-cis retinoic acid, and regulate gene expression in various biological processes. The RXR/RAR heterodimers bind to the retinoic acid response elements (RARE) composed of tandem 5'-AGGTCA-3' sites known as DR1-DR5. In the absence of ligand, the RXR-RAR heterodimers associate with a multiprotein complex containing transcription corepressors that induce histone acetylation, chromatin condensation and transcriptional suppression. On ligand binding, the corepressors dissociate from the receptors and associate with the coactivators leading to transcriptional activation. RARA plays an essential role in the regulation of retinoic acid-induced germ cell development during spermatogenesis. Has a role in the survival of early spermatocytes at the beginning prophase of meiosis. In Sertoli cells, may promote the survival and development of early meiotic prophase spermatocytes. In concert with RARG, required for skeletal growth, matrix homeostasis and growth plate function (By similarity). Regulates expression of target genes in a ligand- dependent manner by recruiting chromatin complexes containing KMT2E/MLL5. Mediates retinoic acid-induced granulopoiesis. {ECO:0000250, ECO:0000269PubMed:16417524, ECO:0000269PubMed:19377461, ECO:0000269PubMed:19850744, ECO:0000269PubMed:20215566}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus. Cytoplasm. Note=Nuclear localization depends on ligand binding, phosphorylation and sumoylation. Transloaction to the nucleus in the absence of ligand is dependent on activation of PKC and the downstream MAPK phosphorylation. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | Note=Chromosomal aberrations involving RARA are commonly found in acute promyelocytic leukemia. Translocation t(11;17)(q32;q21) with ZBTB16/PLZF; translocation t(15;17)(q21;q21) with PML; translocation t(5;17)(q32;q11) with NPM. The PML-RARA oncoprotein requires both the PML ring structure and coiled-coil domain for both interaction with UBE2I, nuclear microspeckle location and sumoylation. In addition, the coiled- coil domain functions in blocking RA-mediated transactivation and cell differentiation. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 188 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 62 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000536
Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core IPR001723 Steroid hormone receptor IPR003070 Orphan nuclear receptor IPR003078 Retinoic acid receptor IPR008946 Nuclear hormone receptor, ligand-binding |
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PFAM |
PF00104
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PRINTS |
PR00398
PR01284 PR01292 |
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00430
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P10276 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P10276 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 5914 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.654583 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001138774 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:9864 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 180240 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS45671 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 06769 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB067754 AC080112 AF088889 AF088890 AF088891 AF088892 AF088893 AF088894 AF088895 AF283809 BC008727 BC071733 FJ487576 U41742 U41743 X06538 X06614 X56058 X58685 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB00112 AAB00113 AAD05222 AAF87249 AAH08727 AAH71733 ACK86665 BAB62809 CAA29787 CAA29829 CAA39533 CAA41532 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||