Homo sapiens Protein: TCEA2 | |||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-381284.5 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | TCEA2 | ||||||||||||||||||
Protein Name | transcription elongation factor A (SII), 2 | ||||||||||||||||||
Synonyms | TFIIS; | ||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000416026 | ||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-87740 (TCEA2) | ||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
Function | Necessary for efficient RNA polymerase II transcription elongation past template-encoded arresting sites. The arresting sites in DNA have the property of trapping a certain fraction of elongating RNA polymerases that pass through, resulting in locked ternary complexes. Cleavage of the nascent transcript by S-II allows the resumption of elongation from the new 3'-terminus. {ECO:0000269PubMed:12034815}. | ||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus. | ||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Testis and ovary specific. {ECO:0000269PubMed:8566795}. | ||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 36 experimentally validated interaction(s) in this database.
|
||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||
Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001222
Zinc finger, TFIIS-type IPR003617 Transcription elongation factor, TFIIS/CRSP70, N-terminal, sub-type IPR003618 Transcription elongation factor S-II, central domain IPR006289 Transcription elongation factor, TFIIS IPR016492 Transcription elongation factor, TFIIS-related IPR017890 Transcription elongation factor S-IIM IPR017923 Transcription factor IIS, N-terminal |
||||||||||||||||||
PFAM |
PF01096
PF07500 PF08711 |
||||||||||||||||||
PRINTS | |||||||||||||||||||
PIRSF |
PIRSF006704
|
||||||||||||||||||
SMART |
SM00440
SM00509 SM00510 |
||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q15560 | ||||||||||||||||||
TrEMBL | Q5JRI8 | ||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 6919 | ||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||
RefSeq | XP_006723936 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:11614 | ||||||||||||||||||
OMIM | 604784 | ||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||
HPRD | 16069 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AL355803 AL590548 | ||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||