Homo sapiens Protein: HNRNPU | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-390210.5 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | HNRNPU | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U (scaffold attachment factor A) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | hnRNP U; HNRPU; SAF-A; U21.1; | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000393151 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-107800 (HNRNPU) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Component of the CRD-mediated complex that promotes MYC mRNA stabilization. Binds to pre-mRNA. Has high affinity for scaffold-attached region (SAR) DNA. Binds to double- and single- stranded DNA and RNA. {ECO:0000269PubMed:19029303}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus. Cytoplasm. Cell surface. Note=Localized in cytoplasmic mRNP granules containing untranslated mRNAs. Component of ribonucleosomes. Also found associated with the cell surface. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 328 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 7 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001870
B30.2/SPRY domain IPR003034 SAP domain IPR003877 SPRY domain IPR008985 Concanavalin A-like lectin/glucanases superfamily IPR010488 Zeta toxin domain IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
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PFAM |
PF02037
PF00622 PF06414 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00513
SM00449 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q00839 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q00839 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q9UEL2 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 3192 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.709028 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_004492 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:5048 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 602869 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS31081 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 04185 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AF068846 AF461014 AK297119 BC003367 BC003621 BC007950 BC024767 BC034925 BX323046 CH471148 D13413 X65488 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC19382 AAH03367 AAH03621 AAH07950 AAH24767 AAH34925 AAP97707 BAA02679 BAG59625 CAA46472 CAI11058 EAW77126 | ||||||||||||||||||||||