Homo sapiens Protein: STAB1 | |||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-39111.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | STAB1 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | stabilin 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | CLEVER-1; FEEL-1; FELE-1; FEX1; STAB-1; | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000312946 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-39109 (STAB1) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Acts as a scavenger receptor for acetylated low density lipoprotein. Binds to both Gram-positive and Gram-negative bacteria and may play a role in defense against bacterial infection. When inhibited in endothelial tube formation assays, there is a marked decrease in cell-cell interactions, suggesting a role in angiogenesis. Involved in the delivery of newly synthesized CHID1/SI-CLP from the biosynthetic compartment to the endosomal/lysosomal system. {ECO:0000269PubMed:12077138, ECO:0000269PubMed:16357325}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Membrane {ECO:0000305}; Single-pass type I membrane protein {ECO:0000305}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | High levels found in spleen, lymph node, liver and placenta. Also expressed in endothelial cells. {ECO:0000269PubMed:11829752, ECO:0000269PubMed:12077138}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 9 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||
Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000538
Link IPR000742 Epidermal growth factor-like domain IPR000782 FAS1 domain IPR001881 EGF-like calcium-binding domain IPR002049 EGF-like, laminin IPR016187 C-type lectin fold |
||||||||||||||||||||||
PFAM |
PF00193
PF00008 PF02469 PF07645 PF00053 |
||||||||||||||||||||||
PRINTS |
PR01265
|
||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00445
SM00181 SM00554 SM00179 SM00180 |
||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9NY15 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9NY15 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 23166 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.301989 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_055951 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:18628 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 608560 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS33768 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 09778 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AB052956 AB052957 AC006208 AC112215 AJ275213 BC150250 D87433 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI50251 BAA13377 BAC15606 BAC15607 CAB61827 | ||||||||||||||||||||||