Homo sapiens Protein: MAP1LC3B | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-45640.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | MAP1LC3B | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | microtubule-associated protein 1 light chain 3 beta | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000268607 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-45638 (MAP1LC3B) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Ubiquitin-like modifier involved in formation of autophagosomal vacuoles (autophagosomes). Plays a role in mitophagy which contributes to regulate mitochondrial quantity and quality by eliminating the mitochondria to a basal level to fulfill cellular energy requirements and preventing excess ROS production. Whereas LC3s are involved in elongation of the phagophore membrane, the GABARAP/GATE-16 subfamily is essential for a later stage in autophagosome maturation. Promotes primary ciliogenesis by removing OFD1 from centriolar satellites via the autophagic pathway. {ECO:0000269PubMed:20418806, ECO:0000269PubMed:23209295, ECO:0000269PubMed:24089205}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm, cytoskeleton. Endomembrane system; Lipid-anchor. Cytoplasmic vesicle, autophagosome membrane; Lipid-anchor. Note=LC3-II binds to the autophagic membranes. Localizes also to discrete punctae along the ciliary axoneme (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Most abundant in heart, brain, skeletal muscle and testis. Little expression observed in liver. {ECO:0000269PubMed:12740394}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 154 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR004241
Autophagy protein Atg8 ubiquitin like IPR007242 Ubiquitin-like protein Atg12 IPR029071 Ubiquitin-related domain |
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PFAM |
PF02991
PF04110 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART | |||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9GZQ8 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9GZQ8 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q658J6 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 81631 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.717559 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_073729 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:13352 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 609604 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS10960 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 14358 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC010531 AF087871 AF183417 AF303888 AK025556 AK290956 AL834298 BC018634 BC041874 BC045759 BC067797 CH471114 JN663879 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAG09686 AAG23182 AAH18634 AAH41874 AAH45759 AAH67797 AAM10499 AEZ06292 BAB15169 BAF83645 CAD38970 EAW95393 EAW95394 EAW95396 EAW95398 | ||||||||||||||||||||||