Homo sapiens Protein: POLR2I | |||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-46499.6 | ||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | POLR2I | ||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide I, 14.5kDa | ||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | hRPB14.5; RPB9; | ||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000221859 | ||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-46497 (POLR2I) | ||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||
Function | DNA-dependent RNA polymerase catalyzes the transcription of DNA into RNA using the four ribonucleoside triphosphates as substrates. Component of RNA polymerase II which synthesizes mRNA precursors and many functional non-coding RNAs. Pol II is the central component of the basal RNA polymerase II transcription machinery. It is composed of mobile elements that move relative to each other. RPB9 is part of the upper jaw surrounding the central large cleft and thought to grab the incoming DNA template (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000269PubMed:9852112}. | ||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 24 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 9 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001222
Zinc finger, TFIIS-type IPR001529 DNA-directed RNA polymerase, M/15kDa subunit |
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PFAM |
PF01096
PF02150 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00440
SM00661 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P36954 | ||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P36954 | ||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | K7EKS1 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 5438 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_006224 | ||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:9196 | ||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 180662 | ||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS12487 | ||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 15944 | ||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AD001527 AK312206 BC017112 BC067794 Z23102 | ||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB51181 AAH17112 AAH67794 BAG35139 CAA80649 | ||||||||||||||||||||||||||||