Homo sapiens Protein: EIF2C2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-474041.4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | EIF2C2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | eukaryotic translation initiation factor 2C, 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000430176 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-37096 (EIF2C2) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Required for RNA-mediated gene silencing (RNAi) by the RNA-induced silencing complex (RISC). The 'minimal RISC' appears to include AGO2 bound to a short guide RNA such as a microRNA (miRNA) or short interfering RNA (siRNA). These guide RNAs direct RISC to complementary mRNAs that are targets for RISC-mediated gene silencing. The precise mechanism of gene silencing depends on the degree of complementarity between the miRNA or siRNA and its target. Binding of RISC to a perfectly complementary mRNA generally results in silencing due to endonucleolytic cleavage of the mRNA specifically by AGO2. Binding of RISC to a partially complementary mRNA results in silencing through inhibition of translation, and this is independent of endonuclease activity. May inhibit translation initiation by binding to the 7-methylguanosine cap, thereby preventing the recruitment of the translation initiation factor eIF4-E. May also inhibit translation initiation via interaction with EIF6, which itself binds to the 60S ribosomal subunit and prevents its association with the 40S ribosomal subunit. The inhibition of translational initiation leads to the accumulation of the affected mRNA in cytoplasmic processing bodies (P-bodies), where mRNA degradation may subsequently occur. In some cases RISC-mediated translational repression is also observed for miRNAs that perfectly match the 3' untranslated region (3'-UTR). Can also up-regulate the translation of specific mRNAs under certain growth conditions. Binds to the AU element of the 3'-UTR of the TNF (TNF-alpha) mRNA and up-regulates translation under conditions of serum starvation. Also required for transcriptional gene silencing (TGS), in which short RNAs known as antigene RNAs or agRNAs direct the transcriptional repression of complementary promoter regions. {ECO:0000269PubMed:15105377, ECO:0000269PubMed:15260970, ECO:0000269PubMed:15284456, ECO:0000269PubMed:15337849, ECO:0000269PubMed:15800637, ECO:0000269PubMed:16081698, ECO:0000269PubMed:16142218, ECO:0000269PubMed:16271387, ECO:0000269PubMed:16289642, ECO:0000269PubMed:16357216, ECO:0000269PubMed:16756390, ECO:0000269PubMed:16936728, ECO:0000269PubMed:17382880, ECO:0000269PubMed:17507929, ECO:0000269PubMed:17524464, ECO:0000269PubMed:17531811, ECO:0000269PubMed:17932509, ECO:0000269PubMed:18048652, ECO:0000269PubMed:18178619, ECO:0000269PubMed:18690212, ECO:0000269PubMed:18771919, ECO:0000269PubMed:19167051, ECO:0000269PubMed:23746446}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm, P-body. Nucleus. Note=Translational repression of mRNAs results in their recruitment to P-bodies. Translocation to the nucleus requires IMP8. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 135 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 7 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR003100
PAZ domain IPR003165 Stem cell self-renewal protein Piwi IPR012337 Ribonuclease H-like domain IPR014811 Domain of unknown function DUF1785 |
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PFAM |
PF02170
PF02171 PF08699 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00949
SM00950 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9UKV8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9UKV8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | E5RJY2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 27161 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.713705 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001158095 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:3263 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 606229 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS55279 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 06943 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC067931 AC107375 AF121255 AY077717 BC007633 BC018727 BC125214 BT007229 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAF13034 AAH07633 AAH18727 AAL76093 AAP35893 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||