Homo sapiens Protein: U2AF1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-474128.4 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | U2AF1 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | U2 small nuclear RNA auxiliary factor 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000418705 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-4654 (U2AF1) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Plays a critical role in both constitutive and enhancer- dependent splicing by mediating protein-protein interactions and protein-RNA interactions required for accurate 3'-splice site selection. Recruits U2 snRNP to the branch point. Directly mediates interactions between U2AF2 and proteins bound to the enhancers and thus may function as a bridge between U2AF2 and the enhancer complex to recruit it to the adjacent intron. {ECO:0000269PubMed:8647433}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000269PubMed:15096518}. Nucleus speckle {ECO:0000269PubMed:15096518}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 139 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000504
RNA recognition motif domain IPR000571 Zinc finger, CCCH-type IPR003954 RNA recognition motif domain, eukaryote IPR009145 U2 auxiliary factor small subunit |
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PFAM |
PF00076
PF00642 |
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PRINTS |
PR01848
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00360
SM00356 SM00361 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q01081 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q01081 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 7307 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.738829 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | |||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:12453 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 191317 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS42948 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 01871 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AF370386 AJ627978 AP001631 AP001748 BC001177 BC001923 CH471079 M96982 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA36619 AAH01177 AAH01923 AAQ15222 BAA95534 CAF29556 EAX09501 EAX09502 EAX09504 EAX09505 | ||||||||||||||||||||||