Homo sapiens Protein: VCAN | |||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-485211.4 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | VCAN | ||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | versican | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CSPG2; ERVR; GHAP; PG-M; WGN; WGN1; | ||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000421362 | ||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-32298 (VCAN) | ||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||
Function | May play a role in intercellular signaling and in connecting cells with the extracellular matrix. May take part in the regulation of cell motility, growth and differentiation. Binds hyaluronic acid. | ||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Secreted, extracellular space, extracellular matrix. | ||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | Wagner vitreoretinopathy (WGVRP) [MIM:143200]: A rare vitreoretinopathy characterized by an optically empty vitreous cavity with fibrillary condensations and a preretinal avascular membrane. Other optical features include progressive chorioretinal atrophy, perivascular sheating, subcapsular cataract and myopia. {ECO:0000269PubMed:16043844, ECO:0000269PubMed:22739342}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry. The pathological mechanism involves a quantitave imbalance of the normally occurring splice variants (PubMed:22739342). {ECO:0000269PubMed:22739342}. | ||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Cerebral white matter and plasma. Isoform V0 and isoform V1 are expressed in normal brain, gliomas, medulloblastomas, schwannomas, neurofibromas, and meningiomas. Isoform V2 is restricted to normal brain and gliomas. Isoform V3 is found in all these tissues except medulloblastomas. | ||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 34 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000436
Sushi/SCR/CCP IPR000538 Link IPR000742 Epidermal growth factor-like domain IPR001304 C-type lectin IPR001881 EGF-like calcium-binding domain IPR002353 Type-2 ice-structuring protein IPR003599 Immunoglobulin subtype IPR007110 Immunoglobulin-like domain IPR013106 Immunoglobulin V-set domain IPR016187 C-type lectin fold |
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PFAM |
PF00084
PF00193 PF00008 PF00059 PF07645 PF07686 |
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PRINTS |
PR01265
PR00356 |
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00032
SM00445 SM00181 SM00034 SM00179 SM00409 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P13611 | ||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P13611 | ||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 1462 | ||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.653683 | ||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001119808 | ||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:2464 | ||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 118661 | ||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS47242 | ||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 00340 | ||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF084545 D32039 J02814 S52488 U16306 U26555 X15998 | ||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA36437 AAA65018 AAA67565 AAB24878 AAD48545 BAA06801 CAA34128 | ||||||||||||||||||||||||||