Homo sapiens Protein: SNX1 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-583666.3 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | SNX1 | ||||||||||||||||||
Protein Name | sorting nexin 1 | ||||||||||||||||||
Synonyms | HsT17379; VPS5; | ||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000453567 | ||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-16207 (SNX1) | ||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
Function | May be involved in several stages of intracellular trafficking. Plays a role in targeting ligand-activated EGFR to the lysosomes for degradation after endocytosis from the cell surface and release from the Golgi. Component of the retromer complex, a complex required to retrieve lysosomal enzyme receptors (IGF2R and M6PR) from endosomes to the trans-Golgi network. Interacts with membranes containing phosphatidylinositol 3- phosphate (PtdIns(3P)) or phosphatidylinositol 3,5-bisphosphate (PtdIns(3,5)P2). {ECO:0000269PubMed:12198132, ECO:0000269PubMed:15498486, ECO:0000269PubMed:17101778}. | ||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Endosome membrane; Peripheral membrane protein; Cytoplasmic side. Golgi apparatus, trans-Golgi network membrane {ECO:0000305}; Peripheral membrane protein {ECO:0000305}; Cytoplasmic side {ECO:0000305}. Early endosome membrane; Peripheral membrane protein; Cytoplasmic side. Note=Enriched on tubular elements of the early endosome membrane. Binds preferentially to highly curved membranes enriched in phosphatidylinositol 3-phosphate (PtdIns(3P)) or phosphatidylinositol 3,5-bisphosphate (PtdIns(3,5)P2). | ||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 58 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001683
Phox homologous domain IPR005329 Sorting nexin, N-terminal IPR015404 Vps5 C-terminal |
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PFAM |
PF00787
PF03700 PF09325 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||
SMART |
SM00312
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | Q13596 | ||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q13596 | ||||||||||||||||||
TrEMBL | H0YK42 | ||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 6642 | ||||||||||||||||||
UniGene | Hs.703547 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NP_683758 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:11172 | ||||||||||||||||||
OMIM | 601272 | ||||||||||||||||||
CCDS | CCDS32268 | ||||||||||||||||||
HPRD | 03171 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AC021541 AC100840 AF065483 AF065484 AK128179 AK291752 BC000357 BT006983 CH471082 U53225 | ||||||||||||||||||
GenPept | AAA98672 AAC17182 AAC17183 AAH00357 AAP35629 BAC87312 BAF84441 EAW77663 EAW77665 | ||||||||||||||||||