Homo sapiens Protein: SF3B2 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-58373.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SF3B2 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | splicing factor 3b, subunit 2, 145kDa | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | Cus1; SAP145; SF3b1; SF3B145; SF3b150; | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000318861 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-58371 (SF3B2) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Subunit of the splicing factor SF3B required for 'A' complex assembly formed by the stable binding of U2 snRNP to the branchpoint sequence (BPS) in pre-mRNA. Sequence independent binding of SF3A/SF3B complex upstream of the branch site is essential, it may anchor U2 snRNP to the pre-mRNA. May also be involved in the assembly of the 'E' complex. Belongs also to the minor U12-dependent spliceosome, which is involved in the splicing of rare class of nuclear pre-mRNA intron. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 143 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 5 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR003034
SAP domain IPR006568 PSP, proline-rich IPR007180 Domain of unknown function DUF382 |
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PFAM |
PF02037
PF04046 PF04037 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00513
SM00581 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q13435 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q13435 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | E9PIL8 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 10992 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.690027 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_006833 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:10769 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 605591 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS31612 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 10410 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AK290850 AK300016 AP006287 BC000401 BC007610 BC014125 BC053577 U41371 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA97461 AAH00401 AAH07610 AAH14125 AAH53577 BAF83539 BAG61831 | ||||||||||||||||||||||