Homo sapiens Protein: H2AFX | |||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-587419.3 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | H2AFX | ||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | H2A histone family, member X | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | H2A.X; H2A/X; H2AX; | ||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000434024 | ||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-74259 (H2AFX) | ||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||
Function | Variant histone H2A which replaces conventional H2A in a subset of nucleosomes. Nucleosomes wrap and compact DNA into chromatin, limiting DNA accessibility to the cellular machineries which require DNA as a template. Histones thereby play a central role in transcription regulation, DNA repair, DNA replication and chromosomal stability. DNA accessibility is regulated via a complex set of post-translational modifications of histones, also called histone code, and nucleosome remodeling. Required for checkpoint-mediated arrest of cell cycle progression in response to low doses of ionizing radiation and for efficient repair of DNA double strand breaks (DSBs) specifically when modified by C- terminal phosphorylation. {ECO:0000269PubMed:10959836, ECO:0000269PubMed:12419185, ECO:0000269PubMed:12607005, ECO:0000269PubMed:15201865}. | ||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus. Chromosome. | ||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 302 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 6 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR002119
Histone H2A IPR003958 Transcription factor CBF/NF-Y/archaeal histone IPR007125 Histone core IPR009072 Histone-fold |
||||||||||||||||||||||||||
PFAM |
PF00808
PF00125 |
||||||||||||||||||||||||||
PRINTS |
PR00620
|
||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00414
|
||||||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P16104 | ||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P16104 | ||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 3014 | ||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_002096 | ||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:4739 | ||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 601772 | ||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS8410 | ||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 03465 | ||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | BC004915 BC011694 BC013416 CR457079 DQ015918 X14850 | ||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH04915 AAH11694 AAH13416 AAY22178 CAA32968 CAG33360 | ||||||||||||||||||||||||||