Homo sapiens Protein: NR1H4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-594644.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | NR1H4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | nuclear receptor subfamily 1, group H, member 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | BAR; FXR; HRR-1; HRR1; RIP14; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000447149 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-52872 (NR1H4) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Ligand-activated transcription factor. Receptor for bile acids such as chenodeoxycholic acid, lithocholic acid and deoxycholic acid. Represses the transcription of the cholesterol 7-alpha-hydroxylase gene (CYP7A1) through the induction of NR0B2 or FGF19 expression, via two distinct mechanisms. Activates the intestinal bile acid-binding protein (IBABP). Activates the transcription of bile salt export pump ABCB11 by directly recruiting histone methyltransferase CARM1 to this locus. {ECO:0000269PubMed:10334992, ECO:0000269PubMed:10334993, ECO:0000269PubMed:12718892, ECO:0000269PubMed:12815072, ECO:0000269PubMed:15471871, ECO:0000269PubMed:18621523, ECO:0000269PubMed:19410460, ECO:0000269PubMed:19586769}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000305}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 34 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 6 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000536
Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core IPR001628 Zinc finger, nuclear hormone receptor-type IPR001723 Steroid hormone receptor IPR001728 Thyroid hormone receptor IPR008946 Nuclear hormone receptor, ligand-binding |
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PFAM |
PF00104
PF00105 |
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PRINTS |
PR00047
PR00398 PR00546 |
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00430
SM00399 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q96RI1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q96RI1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | B7Z423 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 9971 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.734504 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001193922 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:7967 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 603826 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS55876 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 04827 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC010200 AF384555 AF478445 AF478446 AK296612 AK296647 BC130573 BC144183 BC144184 CH471054 U68233 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB08107 AAI30574 AAI44185 AAK60271 AAM53550 AAM53551 BAH12398 BAH12409 EAW97639 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||