Homo sapiens Protein: PAN2 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-597338.3 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | PAN2 | ||||||||||||||||||
Protein Name | PAN2 poly(A) specific ribonuclease subunit homolog (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||
Synonyms | USP52; | ||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000449861 | ||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-40746 (PAN2) | ||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
Function | Catalytic subunit of the poly(A)-nuclease (PAN) deadenylation complex, one of two cytoplasmic mRNA deadenylases involved in general and miRNA-mediated mRNA turnover. PAN specifically shortens poly(A) tails of RNA when the poly(A) stretch is bound by poly(A)-binding protein (PABP), which is followed by rapid degradation of the shortened mRNA tails by the CCR4-NOT complex. Deadenylated mRNAs are then degraded by two alternative mechanisms, namely exosome-mediated 3'-5' exonucleolytic degradation, or deadenlyation-dependent mRNA decaping and subsequent 5'-3' exonucleolytic degradation by XRN1. {ECO:0000255HAMAP-Rule:MF_03182, ECO:0000269PubMed:14583602, ECO:0000269PubMed:16284618}. | ||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm, P-body. Nucleus. Note=Shuttles between nucleus and cytoplasm. | ||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 344 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001394
Peptidase C19, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase IPR006055 Exonuclease IPR012337 Ribonuclease H-like domain IPR013520 Exonuclease, RNase T/DNA polymerase III IPR017986 WD40-repeat-containing domain IPR028889 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase-like domain |
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PFAM |
PF00443
PF00929 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||
SMART |
SM00479
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | Q504Q3 | ||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q504Q3 | ||||||||||||||||||
TrEMBL | F8VXK8 | ||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 9924 | ||||||||||||||||||
UniGene | Hs.273397 | ||||||||||||||||||
RefSeq | |||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:20074 | ||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | CCDS44922 | ||||||||||||||||||
HPRD | 15640 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AB014610 AB107585 AC025574 AC073896 BC024043 BC094885 | ||||||||||||||||||
GenPept | AAH24043 AAH94885 BAA31685 BAD02263 | ||||||||||||||||||