Homo sapiens Protein: CAPN3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-7671.7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CAPN3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | calpain 3, (p94) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CANP3; CANPL3; LGMD2; LGMD2A; nCL-1; p94; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000183936 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-7659 (CAPN3) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Calcium-regulated non-lysosomal thiol-protease. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | Limb-girdle muscular dystrophy 2A (LGMD2A) [MIM:253600]: An autosomal recessive degenerative myopathy characterized by progressive symmetrical atrophy and weakness of the proximal limb muscles and elevated serum creatine kinase. The symptoms usually begin during the first two decades of life, and the disease gradually worsens, often resulting in loss of walking ability 10 or 20 years after onset. {ECO:0000269PubMed:7720071, ECO:0000269PubMed:8624690, ECO:0000269PubMed:9150160, ECO:0000269PubMed:9266733, ECO:0000269PubMed:9452114, ECO:0000269PubMed:9655129, ECO:0000269PubMed:9762961, ECO:0000269PubMed:9771675}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Isoform I is skeletal muscle specific. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 5 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001300
Peptidase C2, calpain, catalytic domain IPR002048 EF-hand domain IPR022682 Peptidase C2, calpain, large subunit, domain III IPR022683 Peptidase C2, calpain, domain III IPR022684 Peptidase C2, calpain family |
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PFAM |
PF00648
PF00036 PF13202 PF13405 PF01067 |
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PRINTS |
PR00704
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00230
SM00054 SM00720 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P20807 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P20807 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | H3BS30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 825 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.733336 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_775110 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:1480 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 114240 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS10085 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 00255 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC012651 AF127764 AF127765 AF209502 AY902237 BC003169 BC003521 BC004883 BC007810 BC067126 BC100782 BC107791 BC128605 BC146649 BC146672 BT007322 X85030 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAD28253 AAD28254 AAH03169 AAH03521 AAH04883 AAH07810 AAH67126 AAI00783 AAI07792 AAI28606 AAI46650 AAI46673 AAL40183 AAP35986 AAW69391 CAA59403 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||