Homo sapiens Protein: COL5A2 | |||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-77229.6 | ||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||
Gene Symbol | COL5A2 | ||||||||||||||||||||
Protein Name | collagen, type V, alpha 2 | ||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000364000 | ||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-77225 (COL5A2) | ||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||
Function | Type V collagen is a member of group I collagen (fibrillar forming collagen). It is a minor connective tissue component of nearly ubiquitous distribution. Type V collagen binds to DNA, heparan sulfate, thrombospondin, heparin, and insulin. Type V collagen is a key determinant in the assembly of tissue- specific matrices (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Secreted, extracellular space, extracellular matrix {ECO:0000255PROSITE-ProRule:PRU00793}. | ||||||||||||||||||||
Disease Associations | Ehlers-Danlos syndrome 1 (EDS1) [MIM:130000]: A connective tissue disorder characterized by hyperextensible skin, atrophic cutaneous scars due to tissue fragility and joint hyperlaxity. EDS1 is the severe form of classic Ehlers-Danlos syndrome. {ECO:0000269PubMed:9425231}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry.Ehlers-Danlos syndrome 2 (EDS2) [MIM:130010]: Mild form of classic Ehlers-Danlos syndrome. {ECO:0000269PubMed:9783710}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry. | ||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000885
Fibrillar collagen, C-terminal IPR001007 von Willebrand factor, type C IPR002181 Fibrinogen, alpha/beta/gamma chain, C-terminal globular domain IPR008160 Collagen triple helix repeat |
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PFAM |
PF01410
PF00093 PF00147 PF01391 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||
SMART |
SM00038
SM00214 SM00186 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||
SwissProt | P05997 | ||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P05997 | ||||||||||||||||||||
TrEMBL | D3DPH5 | ||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 1290 | ||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.705959 | ||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_000384 | ||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:2210 | ||||||||||||||||||||
OMIM | 120190 | ||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS33350 | ||||||||||||||||||||
HPRD | 00366 | ||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||
EMBL | AB209045 AC064833 AC133106 AY016287 AY016288 AY016289 AY016290 AY016291 AY016292 AY016293 AY016294 AY016295 BC043613 CH471058 J03051 J04478 M10956 M11135 M11718 M58529 X04758 Y14690 | ||||||||||||||||||||
GenPept | AAA51857 AAA51858 AAA51859 AAA52007 AAA52058 AAC41699 AAH43613 AAL13165 AAL13166 AAY24185 BAD92282 CAA28454 CAA75002 EAX10907 EAX10908 | ||||||||||||||||||||