Homo sapiens Protein: PDLIM1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-83351.5 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PDLIM1 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | PDZ and LIM domain 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | CLIM1; CLP-36; CLP36; hCLIM1; HEL-S-112; | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000360305 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-83349 (PDLIM1) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Cytoskeletal protein that may act as an adapter that brings other proteins (like kinases) to the cytoskeleton. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm {ECO:0000250}. Cytoplasm, cytoskeleton {ECO:0000250}. Note=Associates with the actin stress fibers. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Strongly expressed in the heart and skeletal muscle, moderately expressed in the spleen, small intestine, colon, placenta, and lung. A lower level expression is seen in liver, thymus, kidney, prostate and pancreas and is not found in the brain, testis, ovary, and peripheral blood leukocytes. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 25 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001478
PDZ domain IPR001781 Zinc finger, LIM-type IPR006643 ZASP |
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PFAM |
PF00595
PF13180 PF00412 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00228
SM00132 SM00735 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | O00151 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-O00151 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | V9HW92 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 9124 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_066272 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:2067 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 605900 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS7441 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 09326 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AJ310549 AK314792 AL157834 AL160288 AY923052 BC000915 BC018755 CH471066 FJ224331 U90878 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC05580 AAH00915 AAH18755 AAW82438 ACI46023 BAG37323 CAC32846 CAH70720 CAH72341 EAW50009 | ||||||||||||||||||||||