Homo sapiens Protein: SLIT1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-84203.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SLIT1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | slit homolog 1 (Drosophila) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | MEGF4; SLIL1; SLIT-1; SLIT3; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000266058 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-84201 (SLIT1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Thought to act as molecular guidance cue in cellular migration, and function appears to be mediated by interaction with roundabout homolog receptors. During neural development involved in axonal navigation at the ventral midline of the neural tube and projection of axons to different regions (By similarity). SLIT1 and SLIT2 together seem to be essential for midline guidance in the forebrain by acting as repulsive signal preventing inappropriate midline crossing by axons projecting from the olfactory bulb. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Secreted {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Predominantly expressed in adult forebrain. Expressed in fetal brain, lung and kidney. {ECO:0000269PubMed:9813312}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000372
Leucine-rich repeat-containing N-terminal IPR000483 Cysteine-rich flanking region, C-terminal IPR000742 Epidermal growth factor-like domain IPR001611 Leucine-rich repeat IPR001791 Laminin G domain IPR001881 EGF-like calcium-binding domain IPR003591 Leucine-rich repeat, typical subtype IPR003645 Follistatin-like, N-terminal IPR006207 Cystine knot, C-terminal IPR008985 Concanavalin A-like lectin/glucanases superfamily |
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PFAM |
PF01462
PF01463 PF00008 PF00560 PF13504 PF13855 PF00054 PF02210 PF07645 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00013
SM00082 SM00181 SM00210 SM00282 SM00179 SM00369 SM00274 SM00041 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | O75093 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-O75093 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 6585 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.721483 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_003052 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:11085 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 603742 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS7453 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 04773 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB011537 AB017167 AL442123 AL512424 AY029183 BC146851 CH471066 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI46852 AAK31796 BAA32465 BAA35184 CAH70918 CAI14258 EAW49958 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||