Homo sapiens Protein: TAF5 | |||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-88425.5 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TAF5 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | TAF5 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, 100kDa | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | TAF2D; TAFII100; | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000358854 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-88423 (TAF5) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | TAFs are components of the transcription factor IID (TFIID) complex, PCAF histone acetylase complex and TBP-free TAFII complex (TFTC). TAFs components-TIIFD are essential for mediating regulation of RNA polymerase transcription. TAF5/TAFII100 interacts strongly with the histone H4-related TAF6/TAFII80 and the histone H3-related TAF9/TAFII31, as well as a stable complex comprised of both TAF5/TAFII80 and TAF6/TAFII31. Apparently weaker interactions of TAF5/TAFII100 with TBP, TAF1/TAFII250, TAF11/TAFII28, and TAF12/TAFII20, but not TAF7/TAFII55, also have been observed. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 46 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||
Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001680
WD40 repeat IPR006594 LisH dimerisation motif IPR007582 TFIID subunit, WD40-associated region IPR017986 WD40-repeat-containing domain IPR020472 G-protein beta WD-40 repeat |
||||||||||||||||||||||
PFAM |
PF00400
PF04494 |
||||||||||||||||||||||
PRINTS |
PR00320
|
||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00320
SM00667 |
||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q15542 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q15542 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 6877 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.96103 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_008882 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:11539 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 601787 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS7547 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 11876 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AK223615 AK291229 AL591408 BC052268 BC136340 BC136348 CH471066 U75309 U80191 X95525 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC50902 AAC51215 AAH52268 AAI36341 AAI36349 BAD97335 BAF83918 CAA64777 CAI16747 EAW49645 EAW49646 | ||||||||||||||||||||||