Homo sapiens Protein: CDC5L | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-89606.5 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CDC5L | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | CDC5 cell division cycle 5-like (S. pombe) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | CDC5; CDC5-LIKE; CEF1; dJ319D22.1; PCDC5RP; | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000360532 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-89604 (CDC5L) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | DNA-binding protein involved in cell cycle control. May act as a transcription activator. Component of the PRP19-CDC5L complex that forms an integral part of the spliceosome and is required for activating pre-mRNA splicing. {ECO:0000269PubMed:10570151, ECO:0000269PubMed:11082045, ECO:0000269PubMed:11101529, ECO:0000269PubMed:11544257, ECO:0000269PubMed:12927788, ECO:0000269PubMed:18583928, ECO:0000269PubMed:9038199, ECO:0000269PubMed:9468527, ECO:0000269PubMed:9632794}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus. Nucleus speckle. Cytoplasm. Note=May shuttle between cytoplasm and nucleus. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | Note=A chromosomal aberration involving CDC5L is found in multicystic renal dysplasia. Translocation t(6;19)(p21;q13.1) with USF2. | ||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Ubiquitously expressed in both fetal and adult tissues. {ECO:0000269PubMed:9038199, ECO:0000269PubMed:9598309, ECO:0000269PubMed:9632794}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 224 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001005
SANT/Myb domain IPR009057 Homeodomain-like IPR017877 Myb-like domain IPR021786 Domain of unknown function DUF3351 |
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PFAM |
PF00249
PF11831 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00717
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q99459 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q99459 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 988 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.617376 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001244 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:1743 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 602868 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS4912 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 04184 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AB007892 AL133262 AL353588 AY518540 BC001568 D85423 U86753 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB61210 AAH01568 AAR89913 BAA20885 BAA24862 CAI20149 CAI40750 | ||||||||||||||||||||||