Version 5.4
| Homo sapiens Gene: SCNM1 | |||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-102306.6 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | SCNM1 | ||||||||||||||||||
| Gene Name | sodium channel modifier 1 | ||||||||||||||||||
| Synonyms | |||||||||||||||||||
| Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
| Ensembl Gene | ENSG00000163156 | ||||||||||||||||||
| Encoded Proteins |
sodium channel modifier 1
sodium channel modifier 1
sodium channel modifier 1
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| Protein Structure | |||||||||||||||||||
| Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
| Entrez Gene | |||||||||||||||||||
| Summary |
This locus represents naturally occurring read-through transcription between the neighboring TNFAIP8L2 (tumor necrosis factor, alpha-induced protein 8-like 2) and SCNM1 (sodium channel modifier 1) genes on chromosome 1. The read-through transcript encodes a protein that shares sequence identity with the downstream gene product but its N-terminal region is shorter due to alternate exon use, compared to the downstream gene. [provided by RefSeq, Mar 2011] SCNM1 is a zinc finger protein and putative splicing factor. In mice, Scnm1 modifies phenotypic expression of Scn8a (MIM 600702) mutations (Buchner et al., 2003 [PubMed 12920299]).[supplied by OMIM, Oct 2009] |
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| Gene Information | |||||||||||||||||||
| Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
| Genomic Location | Chromosome 1:151156664-151170297 | ||||||||||||||||||
| Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||
| Band | q21.3 | ||||||||||||||||||
| Transcripts |
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| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 8 experimentally validated interaction(s) in this database.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Orthologs | |||||||||||||||||||
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Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | |||||||||||||||||||
| TrEMBL | |||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | |||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.732060 | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NM_001204848 NM_001204856 NM_024041 | ||||||||||||||||||
| HUGO | |||||||||||||||||||
| OMIM | |||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS55636 CCDS987 | ||||||||||||||||||
| HPRD | 12162 | ||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| EMBL | |||||||||||||||||||
| GenPept | |||||||||||||||||||
| RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||