Homo sapiens Gene: IFI16 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-103852.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | IFI16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | interferon, gamma-inducible protein 16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | IFNGIP1; PYHIN2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000163565 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
interferon, gamma-inducible protein 16
interferon, gamma-inducible protein 16
interferon, gamma-inducible protein 16
interferon, gamma-inducible protein 16
interferon, gamma-inducible protein 16
interferon, gamma-inducible protein 16
interferon, gamma-inducible protein 16
interferon, gamma-inducible protein 16
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
IFI16, a PYHIN protein, is an intracellular DNA sensor that mediates the induction of interferon-beta (IFNB) by directly associating with IFNB-inducing viral DNA motifs.
IFI16 acts as a nuclear pathogen sensor and interacts with PYCARD and CASP1 to form a functional inflammasome during KSHV infections.
Cyclic-di-GMP-induced levels of IFI16 suppress the expression of TMEM173 (STING).
IFI16 is essential for host defence by clustering into signalling foci with foreign DNA in a switch-like manner and is capable of using the size of naked double stranded DNA as a molecular ruler to distinguish self from nonself.
In herpes simplex virus 1 (HSV-1) infected cells, the stability and function of IFI16 and TMEM173 are dependent on cell derivation and the functional integrity of HSV-1 proteins ICP0 and US3 protein kinase.
IFI16 is a sensor for lentiviral reverse transcription products and restricts HIV-1 replication in macrophages.
IFI16 oligomerizes upon viral DNA sensing in human cytomegalovirus (HCMV) infected-cells. The HCMV major tegument protein pUL83 blocks nuclear IFI16 oligomerization and inhibits IFI16-mediated antiviral cytokine expression
The end result of the interplay between TMEM173 (STING), IFI16, and herpes simplex virus 1 (HSV-1) is determined by the genotype of the infected cells and the functional integrity of HSV-1 proteins infected cell protein 0 (ICP0) and US3 protein kinase.
IFI16 is a sensor for lentiviral reverse transcription products and restricts HIV-1 replication in human macrophages.
IFI16 transcriptionally regulates type-I interferons and DDX58 (RIG-I) and controls the interferon response to both DNA and RNA viruses.
IFI16 and MB21D1 interact and cooperate during herpes simplex virus infection to initiate innate signalling.
IFI16 restricts chromatinized human papillomaviruses DNA through epigenetic modifications, thus reducing both viral replication and transcription.
Single nucleotide polymorphisms in IFI16 and AIM2 are associated with Behçet disease.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a member of the HIN-200 (hematopoietic interferon-inducible nuclear antigens with 200 amino acid repeats) family of cytokines. The encoded protein contains domains involved in DNA binding, transcriptional regulation, and protein-protein interactions. The protein localizes to the nucleoplasm and nucleoli, and interacts with p53 and retinoblastoma-1. It modulates p53 function, and inhibits cell growth in the Ras/Raf signaling pathway. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Apr 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:158999968-159055155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q23.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 23 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
No orthologs found for this gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
ID pathway
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REACTOME |
STING mediated induction of host immune responses pathway
IRF3-mediated induction of type I IFN pathway
Innate Immune System pathway
Immune System pathway
Cytosolic sensors of pathogen-associated DNA pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | H3BM18 H3BVE6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 3428 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.380250 Hs.629190 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001206567 NM_005531 XM_005245127 XM_006711290 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:5395 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 147586 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS1180 CCDS58039 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 00969 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AL359753 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 3428 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||