Mus musculus Gene: Tfap4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-129693.7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Tfap4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | transcription factor AP4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AI642933; AP-4; bHLHc41; D930048N17Rik; Tcfap4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000005718 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
transcription factor AP4
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000090447:
Transcription factors of the basic helix-loop-helix-zipper (bHLH-ZIP) family contain a basic domain, which is used for DNA binding, and HLH and ZIP domains, which are used for oligomerization. Transcription factor AP4 activates both viral and cellular genes by binding to the symmetrical DNA sequence CAGCTG (Mermod et al., 1988 [PubMed 2833704]; Hu et al., 1990 [PubMed 2123466]).[supplied by OMIM, Jul 2009] |
||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 16:4544661-4559720 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | A1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 78 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q8BWA4 Q9JIZ5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 83383 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.273210 Mm.406682 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_031182 XM_006522764 XM_006522766 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS27919 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:103239 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Tfap4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC157597 AF161262 AK053091 AK166424 BC047270 BC054777 CH466521 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAF80448 AAH47270 AAH54777 BAC35263 BAE38767 EDK97233 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 83383 | ||||||||||||||||||||||||||||||||