Version 5.4
| Mus musculus Gene: Ccdc50 | |||||||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-150650.6 | ||||||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
| Gene Symbol | Ccdc50 | ||||||||||||||||||||||
| Gene Name | coiled-coil domain containing 50 | ||||||||||||||||||||||
| Synonyms | C3orf6 | ||||||||||||||||||||||
| Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
| Ensembl Gene | ENSMUSG00000038127 | ||||||||||||||||||||||
| Encoded Proteins |
coiled-coil domain containing 50
coiled-coil domain containing 50
coiled-coil domain containing 50
coiled-coil domain containing 50
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| Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
| Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
| Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
| Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000152492:
This gene encodes a soluble, cytoplasmic, tyrosine-phosphorylated protein with multiple ubiquitin-interacting domains. Mutations in this gene cause nonsyndromic, postlingual, progressive sensorineural DFNA44 hearing loss. In mouse, the protein is expressed in the inner ear during development and postnatal maturation and associates with microtubule-based structures. This protein may also function as a negative regulator of NF-kB signaling and as an effector of epidermal growth factor (EGF)-mediated cell signaling. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding distinct isoforms. [provided by RefSeq, Oct 2008] |
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| Gene Information | |||||||||||||||||||||||
| Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
| Genomic Location | Chromosome 16:27388869-27452218 | ||||||||||||||||||||||
| Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
| Band | B2 | ||||||||||||||||||||||
| Transcripts |
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| Interactions | |||||||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 6 interaction(s) predicted by orthology.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Orthologs | |||||||||||||||||||||||
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Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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| Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
| NETPATH |
EGFR1 pathway
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| REACTOME | |||||||||||||||||||||||
| KEGG | |||||||||||||||||||||||
| INOH | |||||||||||||||||||||||
| PID NCI | |||||||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||||||
| SwissProt | |||||||||||||||||||||||
| TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
| Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
| UniGene | Mm.258985 Mm.408387 Mm.454232 Mm.473460 Mm.473617 | ||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NM_001025615 NM_001289436 NM_026202 XM_006522483 | ||||||||||||||||||||||
| OMIM | |||||||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS37305 CCDS37306 | ||||||||||||||||||||||
| HPRD | |||||||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||||||
| MGI ID | |||||||||||||||||||||||
| MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
| EMBL | |||||||||||||||||||||||
| GenPept | |||||||||||||||||||||||
| RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||