Homo sapiens Gene: LEPREL2 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-15090.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | LEPREL2 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | leprecan-like 2 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | GRCB; HSU47926; P3H3 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000110811 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
leprecan-like 2
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
LEPREL2 belongs to a family of collagen prolyl hydroxylases required for proper collagen biosynthesis, folding, and assembly (Vranka et al., 2004 [PubMed 15044469]).[supplied by OMIM, Mar 2008] The protein encoded by this gene belongs to the leprecan family of proteoglycans, which function as collagen prolyl hydroxylases that are required for proper collagen biosynthesis, folding and assembly. This protein, like other family members, is thought to reside in the endoplasmic reticulum. Epigenetic inactivation of this gene is associated with breast and other cancers, suggesting that it may function as a tumor suppressor. [provided by RefSeq, Aug 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 12:6828410-6839851 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | p13.31 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Collagen biosynthesis and modifying enzymes pathway
Extracellular matrix organization pathway
Collagen formation pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_014262 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS61027 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||