Mus musculus Gene: Hnrnpk | |||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-158280.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Hnrnpk | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | Hnrpk; KBBP; NOVA | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000021546 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K
heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K
|
||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is a component of the heterogeneous nuclear ribonucleoprotein (hnRNP) complex, and is a poly-cytosine binding protein (PCBP). It is found in multiple subcellular compartments including the nucleus, cytoplasm and mitochondria. This gene product is thought to interact with RNA, DNA, and protein, and is involved in multiple cellular processes, including transcription, chromatin remodeling, DNA damage response, signal transduction, mRNA splicing, export, and translation. Multiple transcript variants and protein isoforms exist, with some isoforms containing a unique C-terminus. There are four pseudogenes of this gene, found on chromosomes 2, 3, 7 and 13. [provided by RefSeq, Aug 2014] |
||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 13:58391142-58403343 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | B1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 26 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 164 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
mRNA Splicing pathway
Gene Expression pathway
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
|
||||||||||||||||||||||
KEGG |
Spliceosome pathway
|
||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH |
BCR pathway
|
||||||||||||||||||||||
REACTOME |
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
mRNA Splicing pathway
Gene Expression pathway
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
mRNA Splicing pathway
Gene Expression pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
|
||||||||||||||||||||||
KEGG |
Spliceosome pathway
|
||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.142872 Mm.338129 Mm.402529 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_025279 XM_006517101 XM_006517102 XM_006517103 XM_006517104 XM_006517105 XM_006517106 XM_006517107 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS49283 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||