Version 5.4
| Mus musculus Gene: Ifit1 | |||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-159854.6 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | Ifit1 | ||||||||||||||||||
| Gene Name | interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1 | ||||||||||||||||||
| Synonyms | Ifi56; ISG56; P56 | ||||||||||||||||||
| Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||
| Ensembl Gene | ENSMUSG00000034459 | ||||||||||||||||||
| Encoded Proteins |
interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1
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| Protein Structure |
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| Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
| InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||
| Summary |
Ifit1 recognizes and directly binds to 5'-triphosphate RNA and functions as an innate inhibitor of viral replication and pathogenicity.
Ifit1 is an innate immune network bottleneck with the ability to suppress induction of Tlr4 response genes in LPS-stimulated macrophages.
IFIT1 binds mRNAs that lack 2â?²O methylation on the first ribose, thus inhibiting translation by impairing binding of eukaryotic translation initiation factors to 2â?²O-unmethylated RNA templates
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| Entrez Gene | |||||||||||||||||||
| Summary | Currently no Entrez Summary Available. You might want to check the Summary Sections of the Orthologs. | ||||||||||||||||||
| Gene Information | |||||||||||||||||||
| Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
| Genomic Location | Chromosome 19:34640871-34650009 | ||||||||||||||||||
| Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||
| Band | C1 | ||||||||||||||||||
| Transcripts |
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| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 7 experimentally validated interaction(s) in this database.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Orthologs | |||||||||||||||||||
| No orthologs found for this gene | |||||||||||||||||||
| Pathways | |||||||||||||||||||
| NETPATH | |||||||||||||||||||
| REACTOME |
Cytokine Signaling in Immune system pathway
Antiviral mechanism by IFN-stimulated genes pathway
ISG15 antiviral mechanism pathway
Immune System pathway
Interferon Signaling pathway
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| KEGG |
Hepatitis C pathway
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| INOH | |||||||||||||||||||
| PID NCI | |||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | Q64282 | ||||||||||||||||||
| TrEMBL | Q3U726 | ||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 15957 | ||||||||||||||||||
| UniGene | Mm.439751 Mm.473606 | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NM_008331 | ||||||||||||||||||
| OMIM | |||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS29766 | ||||||||||||||||||
| HPRD | |||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| MGI ID | MGI:99450 | ||||||||||||||||||
| MGI Symbol | Ifit1 | ||||||||||||||||||
| EMBL | AK150352 AK150424 AK150609 AK151125 AK151158 AK151278 AK151298 AK152853 AK153184 AK157848 BC003768 CH466534 CT010226 S77714 S77715 U43084 | ||||||||||||||||||
| GenPept | AAB33831 AAC52625 AAH03768 BAE29489 BAE29547 BAE29700 BAE30133 BAE30163 BAE30265 BAE30281 BAE31546 BAE31785 BAE34228 CAJ18434 EDL41756 | ||||||||||||||||||
| RNA Seq Atlas | 15957 | ||||||||||||||||||