Mus musculus Gene: Apoa1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-161189.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Apoa1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | apolipoprotein A-I | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Alp-1; apo-AI; Apoa-1; apoA-I; Brp-14; Ltw-1; Lvtw-1; Sep-1; Sep-2; Sep2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000032083 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
apolipoprotein A-I
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Apoa1 has anti-inflammatory properties in macrophages through the stabilization of ATP-binding cassette transporter A1 (Abca1) and the down-regulation of Tlr4 signalling pathway. (Demonstrated in human)
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InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] APOA1 is a serum apolipoprotein that induces antiatherogenic efflux of macrophage cholesterol and is anti-inflammatory due to its ability to neutralize bacterial lipopolysaccharide (LPS). APOA1 also signals in the macrophage through Toll-like receptor (TLR)2, TLR4, and CD14, utilizing MYD88-dependent and -independent pathways, to activate nuclear factor-kappaB and induce cytokines.
[Homo sapiens] APOA1 has anti-inflammatory properties in macrophages through the stabilization of ATP-binding cassette transporter A1 (ABCA1) and the down-regulation of TLR4 signalling pathway.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a preproprotein that is proteolytically cleaved to yield a signal peptide and a proproptein that is subsequently processed to generate the active mature peptide. The encoded protein is the major protein component of plasma high density lipoprotein (HDL). This protein facilitates the removal of cholesterol and other fats from tissues by transporting them to the liver for excretion. This protein is a cofactor for lecithin cholesterolacyltransferase, an enzyme that catalyzes the conversion of free cholesterol to cholesteryl esters. Mutations in this gene in humans causes familial HDL deficiency, Tangier disease and familial visceral amyloidosis. Similar clinical features are exhibited by mice with mutations in this gene. This gene is clustered with three other apolipoprotein genes on chromosome 9. [provided by RefSeq, Dec 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 9:46228580-46230466 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | A5.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 18 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 64 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Platelet degranulation pathway
Disease pathway
Hemostasis pathway
Fatty acid, triacylglycerol, and ketone body metabolism pathway
Retinoid metabolism and transport pathway
Amyloids pathway
HDL-mediated lipid transport pathway
Metabolism pathway
Platelet activation, signaling and aggregation pathway
Scavenging of heme from plasma pathway
Binding and Uptake of Ligands by Scavenger Receptors pathway
ABCA transporters in lipid homeostasis pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Scavenging by Class A Receptors pathway
Regulation of lipid metabolism by Peroxisome proliferator-activated receptor alpha (PPARalpha) pathway
Lipid digestion, mobilization, and transport pathway
Chylomicron-mediated lipid transport pathway
Lipoprotein metabolism pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
PPARA activates gene expression pathway
Visual phototransduction pathway
ABC-family proteins mediated transport pathway
Response to elevated platelet cytosolic Ca2+ pathway
Signal Transduction pathway
Diseases associated with visual transduction pathway
Scavenging by Class B Receptors pathway
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KEGG |
PPAR signaling pathway pathway
Fat digestion and absorption pathway
African trypanosomiasis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Scavenging of heme from plasma pathway
Platelet degranulation pathway
Response to elevated platelet cytosolic Ca2+ pathway
ABCA transporters in lipid homeostasis pathway
ABC-family proteins mediated transport pathway
Retinoid metabolism and transport pathway
PPARA activates gene expression pathway
Regulation of lipid metabolism by Peroxisome proliferator-activated receptor alpha (PPARalpha) pathway
HDL-mediated lipid transport pathway
Chylomicron-mediated lipid transport pathway
Fatty acid, triacylglycerol, and ketone body metabolism pathway
Amyloids pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Platelet activation, signaling and aggregation pathway
Binding and Uptake of Ligands by Scavenger Receptors pathway
Signal Transduction pathway
Scavenging by Class A Receptors pathway
Scavenging by Class B Receptors pathway
Diseases associated with visual transduction pathway
Visual phototransduction pathway
Lipoprotein metabolism pathway
Metabolism pathway
Lipid digestion, mobilization, and transport pathway
Disease pathway
Hemostasis pathway
Platelet degranulation pathway
Regulation of lipid metabolism by Peroxisome proliferator-activated receptor alpha (PPARalpha) pathway
Amyloids pathway
Chylomicron-mediated lipid transport pathway
ABC-family proteins mediated transport pathway
Retinoid metabolism and transport pathway
ABCA transporters in lipid homeostasis pathway
Lipoprotein metabolism pathway
Hemostasis pathway
Visual phototransduction pathway
Platelet activation, signaling and aggregation pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Response to elevated platelet cytosolic Ca2+ pathway
Scavenging by Class A Receptors pathway
HDL-mediated lipid transport pathway
Signal Transduction pathway
Diseases associated with visual transduction pathway
Binding and Uptake of Ligands by Scavenger Receptors pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Metabolism pathway
Scavenging of heme from plasma pathway
PPARA activates gene expression pathway
Fatty acid, triacylglycerol, and ketone body metabolism pathway
Disease pathway
Scavenging by Class B Receptors pathway
Lipid digestion, mobilization, and transport pathway
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KEGG |
PPAR signaling pathway pathway
Fat digestion and absorption pathway
African trypanosomiasis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
FOXA2 and FOXA3 transcription factor networks
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_009692 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS40610 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||