Mus musculus Gene: Ppargc1a | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-163551.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Ppargc1a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | peroxisome proliferative activated receptor, gamma, coactivator 1 alpha | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | A830037N07Rik; ENSMUSG00000079510; Gm11133; PGC-1; Pgc-1alpha; PGC-1v; Pgc1; Pgco1; Ppargc1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000029167 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
peroxisome proliferative activated receptor, gamma, coactivator 1 alpha
peroxisome proliferative activated receptor, gamma, coactivator 1 alpha
peroxisome proliferative activated receptor, gamma, coactivator 1 alpha
peroxisome proliferative activated receptor, gamma, coactivator 1 alpha
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Ppargc1a is activated in Staphylococcus aureus-mediated sepsis via the Tlr2-signalling pathway.
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InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] PPARGC1A is activated in Staphylococcus aureus-mediated sepsis via the TLR2-signalling pathway. (Demonstrated in mice)
[Homo sapiens] MIR130A reduces hepatitis B virus (HBV) replication by down-regulating the expression of two major metabolic regulators PPARGC1A and PPARG, both of which can potently stimulate HBV replication.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000109819:
The protein encoded by this gene is a transcriptional coactivator that regulates the genes involved in energy metabolism. This protein interacts with PPARgamma, which permits the interaction of this protein with multiple transcription factors. This protein can interact with, and regulate the activities of, cAMP response element binding protein (CREB) and nuclear respiratory factors (NRFs). It provides a direct link between external physiological stimuli and the regulation of mitochondrial biogenesis, and is a major factor that regulates muscle fiber type determination. This protein may be also involved in controlling blood pressure, regulating cellular cholesterol homoeostasis, and the development of obesity. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:51454249-51567725 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | C1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 35 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 50 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Transcriptional Regulation of Adipocyte Differentiation in 3T3-L1 Pre-adipocytes pathway
Rora activates circadian gene expression pathway
Circadian Clock pathway
Transcriptional regulation of white adipocyte differentiation pathway
Organelle biogenesis and maintenance pathway
Mus musculus biological processes pathway
Fatty acid, triacylglycerol, and ketone body metabolism pathway
Circadian Clock pathway
REV-ERBA represses gene expression pathway
RORA activates circadian gene expression pathway
Metabolism pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Regulation of lipid metabolism by Peroxisome proliferator-activated receptor alpha (PPARalpha) pathway
Transcriptional activation of mitochondrial biogenesis pathway
PPARA activates gene expression pathway
Developmental Biology pathway
Mitochondrial biogenesis pathway
Activation of PPARGC1A (PGC-1alpha) by phosphorylation pathway
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KEGG |
Insulin signaling pathway pathway
Adipocytokine signaling pathway pathway
Huntington's disease pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
PPARA activates gene expression pathway
Regulation of lipid metabolism by Peroxisome proliferator-activated receptor alpha (PPARalpha) pathway
Fatty acid, triacylglycerol, and ketone body metabolism pathway
RORA activates circadian gene expression pathway
BMAL1:CLOCK,NPAS2 activates circadian gene expression pathway
REV-ERBA represses gene expression pathway
Circadian Clock pathway
Transcriptional regulation of white adipocyte differentiation pathway
Organelle biogenesis and maintenance pathway
Developmental Biology pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Activation of PPARGC1A (PGC-1alpha) by phosphorylation pathway
Mitochondrial biogenesis pathway
Transcriptional activation of mitochondrial biogenesis pathway
Metabolism pathway
Regulation of lipid metabolism by Peroxisome proliferator-activated receptor alpha (PPARalpha) pathway
Transcriptional activation of mitochondrial biogenesis pathway
Activation of PPARGC1A (PGC-1alpha) by phosphorylation pathway
Transcriptional regulation of white adipocyte differentiation pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Metabolism pathway
REV-ERBA represses gene expression pathway
PPARA activates gene expression pathway
Fatty acid, triacylglycerol, and ketone body metabolism pathway
Mitochondrial biogenesis pathway
RORA activates circadian gene expression pathway
BMAL1:CLOCK,NPAS2 activates circadian gene expression pathway
Developmental Biology pathway
Circadian Clock pathway
Organelle biogenesis and maintenance pathway
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KEGG |
Insulin signaling pathway pathway
Adipocytokine signaling pathway pathway
Huntington's disease pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
mTOR signaling pathway
ATF-2 transcription factor network
Signaling events mediated by HDAC Class III
Signaling mediated by p38-alpha and p38-beta
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q3LIG2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 19017 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_008904 XM_006503774 XM_006503775 XM_006503776 XM_006503777 XM_006503778 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS19282 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1342774 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Ppargc1a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB061324 AC116763 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | BAE46507 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 19017 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||