Homo sapiens Gene: IKZF1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-16397.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | IKZF1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | IKAROS family zinc finger 1 (Ikaros) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Hs.54452; IK1; IKAROS; LyF-1; LYF1; PPP1R92; PRO0758; ZNFN1A1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000185811 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
IKAROS family zinc finger 1 (Ikaros)
IKAROS family zinc finger 1 (Ikaros)
IKAROS family zinc finger 1 (Ikaros)
IKAROS family zinc finger 1 (Ikaros)
IKAROS family zinc finger 1 (Ikaros)
IKAROS family zinc finger 1 (Ikaros)
IKAROS family zinc finger 1 (Ikaros)
IKAROS family zinc finger 1 (Ikaros)
IKAROS family zinc finger 1 (Ikaros)
IKAROS family zinc finger 1 (Ikaros)
IKAROS family zinc finger 1 (Ikaros)
IKAROS family zinc finger 1 (Ikaros)
IKAROS family zinc finger 1 (Ikaros)
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a transcription factor that belongs to the family of zinc-finger DNA binding proteins associated with chromatin remodeling. The expression of this protein is restricted to the fetal and adult hemo-lymphopoietic system, and it functions as a regulator of lymphocyte differentiation. Several alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described for this gene. All isoforms share a common C-terminal domain, which contains two zinc finger motifs that are required for hetero- or homodimerization, and for interactions with other proteins. The isoforms, however, differ in the number of N-terminal zinc finger motifs that bind DNA and contain the nuclear localization signal, resulting in members with and without DNA-binding properties. Only few isoforms contain the requisite three or more N-terminal zinc motifs that confer high affinity binding to a specific core DNA sequence element in the promoters of target genes. The non-DNA-binding isoforms are largely found in the cytoplasm, and thought to function as dominant negative factors. Overexpression of some dominant-negative isoforms have been associated with B-cell malignancies, such as acute lymphoblastic leukemia (ALL). [provided by RefSeq, May 2011] This gene encodes a transcription factor that belongs to the family of zinc-finger DNA-binding proteins associated with chromatin remodeling. The expression of this protein is restricted to the fetal and adult hemo-lymphopoietic system, and it functions as a regulator of lymphocyte differentiation. Several alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described for this gene. Most isoforms share a common C-terminal domain, which contains two zinc finger motifs that are required for hetero- or homo-dimerization, and for interactions with other proteins. The isoforms, however, differ in the number of N-terminal zinc finger motifs that bind DNA and in nuclear localization signal presence, resulting in members with and without DNA-binding properties. Only a few isoforms contain the requisite three or more N-terminal zinc motifs that confer high affinity binding to a specific core DNA sequence element in the promoters of target genes. The non-DNA-binding isoforms are largely found in the cytoplasm, and are thought to function as dominant-negative factors. Overexpression of some dominant-negative isoforms have been associated with B-cell malignancies, such as acute lymphoblastic leukemia (ALL). [provided by RefSeq, May 2014] |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 7:50304124-50405101 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p12.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 59 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 14 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Calcineurin-regulated NFAT-dependent transcription in lymphocytes
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001220765 NM_001220766 NM_001220767 NM_001220768 NM_001220769 NM_001220770 NM_001220771 NM_001220772 NM_001220773 NM_001220774 NM_001220775 NM_001220776 NM_001291838 NM_001291839 NM_001291840 NM_001291841 NM_001291842 NM_001291843 NM_001291844 NM_001291845 NM_006060 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS59055 CCDS69299 CCDS75596 CCDS75597 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||