Mus musculus Gene: Rest | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-173982.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Rest | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | RE1-silencing transcription factor | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2610008J04Rik; AA407358; NRSF | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000029249 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
RE1-silencing transcription factor
RE1-silencing transcription factor
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] RE-1 silencing transcription factor (REST) is part of a repressor complex, along with key components that include histone deacetylase (HDAC) 1 or 2, co-repressor of REST (CoREST), and lysine-specific demethylase (LSD) 1. The HDAC/CoREST/REST/LSD1 repressor complex is a significant component of host innate immunity.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000084093:
This gene encodes a transcriptional repressor that represses neuronal genes in non-neuronal tissues. It is a member of the Kruppel-type zinc finger transcription factor family. It represses transcription by binding a DNA sequence element called the neuron-restrictive silencer element. The protein is also found in undifferentiated neuronal progenitor cells and it is thought that this repressor may act as a master negative regular of neurogenesis. Alternatively spliced transcript variants have been described [provided by RefSeq, Jul 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:77265491-77286432 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | C3.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 10 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 30 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Chromatin organization pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
HDACs deacetylate histones pathway
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KEGG |
Huntington's disease pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
HDACs deacetylate histones pathway
Chromatin organization pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
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KEGG |
Huntington's disease pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q8VIG1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 19712 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.28840 Mm.393678 Mm.394825 Mm.471386 Mm.482359 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_011263 XM_006534841 XM_006534842 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS19372 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:104897 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Rest | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB024496 AK004945 AK156514 BC096434 BC127065 DQ644039 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH96434 AAI27066 ABG35129 BAB23689 BAB82460 BAE33741 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 19712 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||