Mus musculus Gene: Nfix | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-174687.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Nfix | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | nuclear factor I/X | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | CTF; NF-I/X; NF1-X; NFI-X | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000001911 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
nuclear factor I/X
nuclear factor I/X
nuclear factor I/X
nuclear factor I/X
nuclear factor I/X
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000008441:
The protein encoded by this gene is a transcription factor that binds the palindromic sequence 5'-TTGGCNNNNNGCCAA-3 in viral and cellular promoters. The encoded protein can also stimulate adenovirus replication in vitro. Three transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2012] The protein encoded by this gene is a transcription factor that binds the palindromic sequence 5\'-TTGGCNNNNNGCCAA-3 in viral and cellular promoters. The encoded protein can also stimulate adenovirus replication in vitro. Three transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 8:84699876-84800344 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | C2 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 6 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 11 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
RNA Polymerase I, RNA Polymerase III, and Mitochondrial Transcription pathway
RNA Polymerase III Abortive And Retractive Initiation pathway
Gene Expression pathway
RNA Polymerase III Transcription Termination pathway
RNA Polymerase III Transcription pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
RNA Polymerase III Abortive And Retractive Initiation pathway
RNA Polymerase III Transcription Termination pathway
RNA Polymerase III Transcription pathway
RNA Polymerase I, RNA Polymerase III, and Mitochondrial Transcription pathway
Gene Expression pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.475273 Mm.487058 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001081981 NM_001081982 NM_010906 XM_006530761 XM_006530762 XM_006530763 XM_006530764 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS40411 CCDS40412 CCDS40413 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||