Mus musculus Gene: Vhl | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-178105.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Vhl | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | von Hippel-Lindau tumor suppressor | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Vhlh | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000033933 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
von Hippel-Lindau tumor suppressor
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000134086:
Von Hippel-Lindau syndrome (VHL) is a dominantly inherited familial cancer syndrome predisposing to a variety of malignant and benign tumors. A germline mutation of this gene is the basis of familial inheritance of VHL syndrome. The protein encoded by this gene is a component of the protein complex that includes elongin B, elongin C, and cullin-2, and possesses ubiquitin ligase E3 activity. This protein is involved in the ubiquitination and degradation of hypoxia-inducible-factor (HIF), which is a transcription factor that plays a central role in the regulation of gene expression by oxygen. RNA polymerase II subunit POLR2G/RPB7 is also reported to be a target of this protein. Alternatively spliced transcript variants encoding distinct isoforms have been observed. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 6:113623959-113631633 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | E3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 15 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 355 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Class I MHC mediated antigen processing & presentation pathway
Cellular responses to stress pathway
Cellular response to hypoxia pathway
Immune System pathway
Oxygen-dependent proline hydroxylation of Hypoxia-inducible Factor Alpha pathway
Regulation of Hypoxia-inducible Factor (HIF) by oxygen pathway
Antigen processing: Ubiquitination & Proteasome degradation pathway
Adaptive Immune System pathway
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KEGG |
Renal cell carcinoma pathway
Ubiquitin mediated proteolysis pathway
Pathways in cancer pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Antigen processing: Ubiquitination & Proteasome degradation pathway
Oxygen-dependent proline hydroxylation of Hypoxia-inducible Factor Alpha pathway
Cellular responses to stress pathway
Adaptive Immune System pathway
Regulation of Hypoxia-inducible Factor (HIF) by oxygen pathway
Immune System pathway
Cellular response to hypoxia pathway
Class I MHC mediated antigen processing & presentation pathway
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KEGG |
Renal cell carcinoma pathway
Ubiquitin mediated proteolysis pathway
Pathways in cancer pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
HIF-2-alpha transcription factor network
Hypoxic and oxygen homeostasis regulation of HIF-1-alpha
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.29407 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_009507 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS20429 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||