Mus musculus Gene: Itgav | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-184247.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Itgav | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | integrin alpha V | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 1110004F14Rik; 2610028E01Rik; CD51; D430040G12Rik | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000027087 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
integrin alpha V
integrin alpha V
integrin alpha V
integrin alpha V
integrin alpha V
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] ITGAV::ITGB3 is a sensor and activator of innate immunity to herpes simplex virus-1.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a protein that is a member of the integrin superfamily. Integrins are transmembrane receptors involved cell adhesion and signaling, and they are subdivided based on the heterodimer formation of alpha and beta chains. This protein has been shown to heterodimerize with beta 1, beta 3, beta 6 and beta 8. The heterodimer of alpha v and beta 3 forms the Vitronectin receptor. This protein interacts with several extracellular matrix proteins to mediate cell adhesion and may play a role in cell migration. In mouse, deficiency of this gene is associated with defects in vascular morphogenesis in the brain and early post-natal death. [provided by RefSeq, May 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:83724397-83806916 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | D | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 32 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Syndecan interactions pathway
Class I MHC mediated antigen processing & presentation pathway
Signaling by VEGF pathway
Elastic fibre formation pathway
Molecules associated with elastic fibres pathway
Immune System pathway
Extracellular matrix organization pathway
Laminin interactions pathway
VEGFA-VEGFR2 Pathway pathway
Axon guidance pathway
Integrin cell surface interactions pathway
Antigen processing-Cross presentation pathway
Cross-presentation of particulate exogenous antigens (phagosomes) pathway
Signal transduction by L1 pathway
L1CAM interactions pathway
Adaptive Immune System pathway
Developmental Biology pathway
ECM proteoglycans pathway
Non-integrin membrane-ECM interactions pathway
Signal Transduction pathway
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KEGG |
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
ECM-receptor interaction pathway
Regulation of actin cytoskeleton pathway
Small cell lung cancer pathway
Focal adhesion pathway
Arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy (ARVC) pathway
Pathways in cancer pathway
Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) pathway
Dilated cardiomyopathy pathway
Phagosome pathway
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INOH |
Integrin signaling pathway pathway
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PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Cross-presentation of particulate exogenous antigens (phagosomes) pathway
PECAM1 interactions pathway
Cell surface interactions at the vascular wall pathway
Integrin cell surface interactions pathway
Molecules associated with elastic fibres pathway
Elastic fibre formation pathway
Signal transduction by L1 pathway
L1CAM interactions pathway
Developmental Biology pathway
Extracellular matrix organization pathway
Signaling by VEGF pathway
Syndecan interactions pathway
Axon guidance pathway
Signal Transduction pathway
Antigen processing-Cross presentation pathway
Adaptive Immune System pathway
Immune System pathway
ECM proteoglycans pathway
Non-integrin membrane-ECM interactions pathway
VEGFA-VEGFR2 Pathway pathway
Laminin interactions pathway
Class I MHC mediated antigen processing & presentation pathway
Hemostasis pathway
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KEGG |
Regulation of actin cytoskeleton pathway
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
ECM-receptor interaction pathway
Small cell lung cancer pathway
Focal adhesion pathway
Arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy (ARVC) pathway
Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) pathway
Pathways in cancer pathway
Dilated cardiomyopathy pathway
Phagosome pathway
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INOH |
Integrin signaling pathway pathway
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PID NCI |
Beta1 integrin cell surface interactions
Integrins in angiogenesis
Integrin family cell surface interactions
Urokinase-type plasminogen activator (uPA) and uPAR-mediated signaling
Nectin adhesion pathway
Signaling events mediated by focal adhesion kinase
Signaling events mediated by VEGFR1 and VEGFR2
Beta3 integrin cell surface interactions
PDGFR-alpha signaling pathway
Beta5 beta6 beta7 and beta8 integrin cell surface interactions
PDGFR-beta signaling pathway
Osteopontin-mediated events
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | A2AKI5 Q80Y67 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 16410 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.227 Mm.431734 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_008402 XM_006498807 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS16181 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:96608 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Itgav | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AL772301 BC048857 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH48857 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 16410 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||